Protein–RNA interactions for Protein: Q3UPV3

E130208F15Rik, RIKEN cDNA E130208F15 gene, mousemouse

Predictions only

Length 143 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E130208F15RikQ3UPV3 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
E130208F15RikQ3UPV3 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
E130208F15RikQ3UPV3 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
E130208F15RikQ3UPV3 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
E130208F15RikQ3UPV3 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
E130208F15RikQ3UPV3 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
E130208F15RikQ3UPV3 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
E130208F15RikQ3UPV3 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
E130208F15RikQ3UPV3 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
E130208F15RikQ3UPV3 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
E130208F15RikQ3UPV3 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
E130208F15RikQ3UPV3 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
E130208F15RikQ3UPV3 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
E130208F15RikQ3UPV3 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.44□□□□□ -0.58
E130208F15RikQ3UPV3 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
E130208F15RikQ3UPV3 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
E130208F15RikQ3UPV3 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
E130208F15RikQ3UPV3 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC11.43□□□□□ -0.58
E130208F15RikQ3UPV3 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
E130208F15RikQ3UPV3 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
E130208F15RikQ3UPV3 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
E130208F15RikQ3UPV3 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
E130208F15RikQ3UPV3 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
E130208F15RikQ3UPV3 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
E130208F15RikQ3UPV3 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
E130208F15RikQ3UPV3 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
E130208F15RikQ3UPV3 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC11.43□□□□□ -0.58
E130208F15RikQ3UPV3 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC11.43□□□□□ -0.58
E130208F15RikQ3UPV3 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.43□□□□□ -0.58
E130208F15RikQ3UPV3 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
E130208F15RikQ3UPV3 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
E130208F15RikQ3UPV3 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
E130208F15RikQ3UPV3 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC11.43□□□□□ -0.58
E130208F15RikQ3UPV3 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
E130208F15RikQ3UPV3 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
E130208F15RikQ3UPV3 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
E130208F15RikQ3UPV3 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
E130208F15RikQ3UPV3 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
E130208F15RikQ3UPV3 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
E130208F15RikQ3UPV3 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
E130208F15RikQ3UPV3 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
E130208F15RikQ3UPV3 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
E130208F15RikQ3UPV3 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
E130208F15RikQ3UPV3 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.43□□□□□ -0.58
E130208F15RikQ3UPV3 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
E130208F15RikQ3UPV3 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
E130208F15RikQ3UPV3 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
E130208F15RikQ3UPV3 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
E130208F15RikQ3UPV3 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
E130208F15RikQ3UPV3 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC11.42□□□□□ -0.58
E130208F15RikQ3UPV3 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
E130208F15RikQ3UPV3 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
E130208F15RikQ3UPV3 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
E130208F15RikQ3UPV3 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
E130208F15RikQ3UPV3 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
E130208F15RikQ3UPV3 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
E130208F15RikQ3UPV3 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
E130208F15RikQ3UPV3 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
E130208F15RikQ3UPV3 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
E130208F15RikQ3UPV3 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.42□□□□□ -0.58
E130208F15RikQ3UPV3 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
E130208F15RikQ3UPV3 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC11.42□□□□□ -0.58
E130208F15RikQ3UPV3 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
E130208F15RikQ3UPV3 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
E130208F15RikQ3UPV3 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
E130208F15RikQ3UPV3 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
E130208F15RikQ3UPV3 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
E130208F15RikQ3UPV3 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
E130208F15RikQ3UPV3 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
E130208F15RikQ3UPV3 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
E130208F15RikQ3UPV3 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
E130208F15RikQ3UPV3 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
E130208F15RikQ3UPV3 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
E130208F15RikQ3UPV3 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
E130208F15RikQ3UPV3 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
E130208F15RikQ3UPV3 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
E130208F15RikQ3UPV3 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
E130208F15RikQ3UPV3 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.41□□□□□ -0.58
E130208F15RikQ3UPV3 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
E130208F15RikQ3UPV3 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC11.41□□□□□ -0.58
E130208F15RikQ3UPV3 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
E130208F15RikQ3UPV3 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
E130208F15RikQ3UPV3 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
E130208F15RikQ3UPV3 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
E130208F15RikQ3UPV3 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
E130208F15RikQ3UPV3 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
E130208F15RikQ3UPV3 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
E130208F15RikQ3UPV3 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
E130208F15RikQ3UPV3 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
E130208F15RikQ3UPV3 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
E130208F15RikQ3UPV3 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
E130208F15RikQ3UPV3 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
E130208F15RikQ3UPV3 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
E130208F15RikQ3UPV3 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
E130208F15RikQ3UPV3 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
E130208F15RikQ3UPV3 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
E130208F15RikQ3UPV3 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
E130208F15RikQ3UPV3 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
E130208F15RikQ3UPV3 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
E130208F15RikQ3UPV3 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.2 ms