Protein–RNA interactions for Protein: Q3UP24

Nlrc4, NLR family CARD domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 1,024 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nlrc4Q3UP24 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
Nlrc4Q3UP24 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Nlrc4Q3UP24 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Nlrc4Q3UP24 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Nlrc4Q3UP24 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Nlrc4Q3UP24 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Nlrc4Q3UP24 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Nlrc4Q3UP24 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Nlrc4Q3UP24 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Nlrc4Q3UP24 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Nlrc4Q3UP24 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Nlrc4Q3UP24 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Nlrc4Q3UP24 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Nlrc4Q3UP24 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Nlrc4Q3UP24 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Nlrc4Q3UP24 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Nlrc4Q3UP24 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Nlrc4Q3UP24 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Nlrc4Q3UP24 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Nlrc4Q3UP24 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Nlrc4Q3UP24 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Nlrc4Q3UP24 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Nlrc4Q3UP24 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Nlrc4Q3UP24 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Nlrc4Q3UP24 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Nlrc4Q3UP24 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Nlrc4Q3UP24 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Nlrc4Q3UP24 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Nlrc4Q3UP24 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Nlrc4Q3UP24 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Nlrc4Q3UP24 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Nlrc4Q3UP24 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Nlrc4Q3UP24 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Nlrc4Q3UP24 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Nlrc4Q3UP24 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Nlrc4Q3UP24 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Nlrc4Q3UP24 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Nlrc4Q3UP24 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Nlrc4Q3UP24 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Nlrc4Q3UP24 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Nlrc4Q3UP24 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Nlrc4Q3UP24 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Nlrc4Q3UP24 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Nlrc4Q3UP24 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Nlrc4Q3UP24 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Nlrc4Q3UP24 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Nlrc4Q3UP24 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Nlrc4Q3UP24 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Nlrc4Q3UP24 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Nlrc4Q3UP24 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Nlrc4Q3UP24 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Nlrc4Q3UP24 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Nlrc4Q3UP24 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Nlrc4Q3UP24 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Nlrc4Q3UP24 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Nlrc4Q3UP24 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Nlrc4Q3UP24 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Nlrc4Q3UP24 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Nlrc4Q3UP24 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Nlrc4Q3UP24 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Nlrc4Q3UP24 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Nlrc4Q3UP24 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Nlrc4Q3UP24 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Nlrc4Q3UP24 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Nlrc4Q3UP24 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Nlrc4Q3UP24 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Nlrc4Q3UP24 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Nlrc4Q3UP24 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Nlrc4Q3UP24 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Nlrc4Q3UP24 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Nlrc4Q3UP24 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Nlrc4Q3UP24 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Nlrc4Q3UP24 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Nlrc4Q3UP24 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Nlrc4Q3UP24 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Nlrc4Q3UP24 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Nlrc4Q3UP24 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Nlrc4Q3UP24 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Nlrc4Q3UP24 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Nlrc4Q3UP24 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Nlrc4Q3UP24 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Nlrc4Q3UP24 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Nlrc4Q3UP24 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Nlrc4Q3UP24 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Nlrc4Q3UP24 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Nlrc4Q3UP24 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Nlrc4Q3UP24 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Nlrc4Q3UP24 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Nlrc4Q3UP24 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Nlrc4Q3UP24 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Nlrc4Q3UP24 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Nlrc4Q3UP24 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Nlrc4Q3UP24 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Nlrc4Q3UP24 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Nlrc4Q3UP24 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Nlrc4Q3UP24 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Nlrc4Q3UP24 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Nlrc4Q3UP24 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Nlrc4Q3UP24 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Nlrc4Q3UP24 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.4 ms