Protein–RNA interactions for Protein: Q3UNB8

Tmem253, Transmembrane protein 253, mousemouse

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Length 204 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem253Q3UNB8 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tmem253Q3UNB8 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tmem253Q3UNB8 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tmem253Q3UNB8 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tmem253Q3UNB8 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tmem253Q3UNB8 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tmem253Q3UNB8 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tmem253Q3UNB8 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tmem253Q3UNB8 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tmem253Q3UNB8 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tmem253Q3UNB8 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tmem253Q3UNB8 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tmem253Q3UNB8 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tmem253Q3UNB8 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tmem253Q3UNB8 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tmem253Q3UNB8 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tmem253Q3UNB8 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
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Tmem253Q3UNB8 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tmem253Q3UNB8 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tmem253Q3UNB8 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Tmem253Q3UNB8 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tmem253Q3UNB8 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tmem253Q3UNB8 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tmem253Q3UNB8 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tmem253Q3UNB8 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tmem253Q3UNB8 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tmem253Q3UNB8 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tmem253Q3UNB8 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tmem253Q3UNB8 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tmem253Q3UNB8 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tmem253Q3UNB8 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tmem253Q3UNB8 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tmem253Q3UNB8 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tmem253Q3UNB8 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tmem253Q3UNB8 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tmem253Q3UNB8 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tmem253Q3UNB8 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tmem253Q3UNB8 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Tmem253Q3UNB8 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tmem253Q3UNB8 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tmem253Q3UNB8 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tmem253Q3UNB8 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tmem253Q3UNB8 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tmem253Q3UNB8 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
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Tmem253Q3UNB8 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tmem253Q3UNB8 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
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Tmem253Q3UNB8 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tmem253Q3UNB8 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
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Tmem253Q3UNB8 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tmem253Q3UNB8 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tmem253Q3UNB8 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tmem253Q3UNB8 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tmem253Q3UNB8 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tmem253Q3UNB8 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tmem253Q3UNB8 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
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Tmem253Q3UNB8 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tmem253Q3UNB8 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tmem253Q3UNB8 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tmem253Q3UNB8 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Tmem253Q3UNB8 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Tmem253Q3UNB8 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tmem253Q3UNB8 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tmem253Q3UNB8 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tmem253Q3UNB8 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tmem253Q3UNB8 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Tmem253Q3UNB8 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tmem253Q3UNB8 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tmem253Q3UNB8 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tmem253Q3UNB8 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tmem253Q3UNB8 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tmem253Q3UNB8 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tmem253Q3UNB8 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
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Tmem253Q3UNB8 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
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