Protein–RNA interactions for Protein: Q3UMF0

Cobll1, Cordon-bleu protein-like 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,273 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cobll1Q3UMF0 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cobll1Q3UMF0 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cobll1Q3UMF0 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cobll1Q3UMF0 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cobll1Q3UMF0 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cobll1Q3UMF0 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cobll1Q3UMF0 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cobll1Q3UMF0 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cobll1Q3UMF0 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cobll1Q3UMF0 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Cobll1Q3UMF0 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Cobll1Q3UMF0 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Cobll1Q3UMF0 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Cobll1Q3UMF0 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Cobll1Q3UMF0 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cobll1Q3UMF0 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Cobll1Q3UMF0 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cobll1Q3UMF0 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cobll1Q3UMF0 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cobll1Q3UMF0 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cobll1Q3UMF0 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cobll1Q3UMF0 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Cobll1Q3UMF0 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cobll1Q3UMF0 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cobll1Q3UMF0 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Cobll1Q3UMF0 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cobll1Q3UMF0 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cobll1Q3UMF0 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Cobll1Q3UMF0 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cobll1Q3UMF0 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cobll1Q3UMF0 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cobll1Q3UMF0 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cobll1Q3UMF0 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cobll1Q3UMF0 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cobll1Q3UMF0 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cobll1Q3UMF0 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cobll1Q3UMF0 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cobll1Q3UMF0 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cobll1Q3UMF0 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cobll1Q3UMF0 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cobll1Q3UMF0 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cobll1Q3UMF0 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cobll1Q3UMF0 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cobll1Q3UMF0 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cobll1Q3UMF0 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cobll1Q3UMF0 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cobll1Q3UMF0 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cobll1Q3UMF0 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cobll1Q3UMF0 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cobll1Q3UMF0 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cobll1Q3UMF0 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cobll1Q3UMF0 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cobll1Q3UMF0 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cobll1Q3UMF0 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cobll1Q3UMF0 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cobll1Q3UMF0 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cobll1Q3UMF0 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cobll1Q3UMF0 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cobll1Q3UMF0 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cobll1Q3UMF0 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cobll1Q3UMF0 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cobll1Q3UMF0 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cobll1Q3UMF0 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cobll1Q3UMF0 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cobll1Q3UMF0 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cobll1Q3UMF0 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Cobll1Q3UMF0 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cobll1Q3UMF0 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cobll1Q3UMF0 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cobll1Q3UMF0 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cobll1Q3UMF0 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cobll1Q3UMF0 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cobll1Q3UMF0 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cobll1Q3UMF0 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cobll1Q3UMF0 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cobll1Q3UMF0 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cobll1Q3UMF0 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cobll1Q3UMF0 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cobll1Q3UMF0 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cobll1Q3UMF0 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cobll1Q3UMF0 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cobll1Q3UMF0 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cobll1Q3UMF0 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cobll1Q3UMF0 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cobll1Q3UMF0 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cobll1Q3UMF0 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cobll1Q3UMF0 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cobll1Q3UMF0 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cobll1Q3UMF0 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cobll1Q3UMF0 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cobll1Q3UMF0 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cobll1Q3UMF0 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cobll1Q3UMF0 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cobll1Q3UMF0 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cobll1Q3UMF0 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cobll1Q3UMF0 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cobll1Q3UMF0 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cobll1Q3UMF0 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cobll1Q3UMF0 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cobll1Q3UMF0 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.6 ms