Protein–RNA interactions for Protein: Q3UM29

Cog7, Conserved oligomeric Golgi complex subunit 7, mousemouse

Predictions only

Length 770 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cog7Q3UM29 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Cog7Q3UM29 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Cog7Q3UM29 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Cog7Q3UM29 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Cog7Q3UM29 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Cog7Q3UM29 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Cog7Q3UM29 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Cog7Q3UM29 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Cog7Q3UM29 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Cog7Q3UM29 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Cog7Q3UM29 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Cog7Q3UM29 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Cog7Q3UM29 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Cog7Q3UM29 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Cog7Q3UM29 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Cog7Q3UM29 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Cog7Q3UM29 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Cog7Q3UM29 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Cog7Q3UM29 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Cog7Q3UM29 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Cog7Q3UM29 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Cog7Q3UM29 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Cog7Q3UM29 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Cog7Q3UM29 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Cog7Q3UM29 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Cog7Q3UM29 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Cog7Q3UM29 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Cog7Q3UM29 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Cog7Q3UM29 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Cog7Q3UM29 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Cog7Q3UM29 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Cog7Q3UM29 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Cog7Q3UM29 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Cog7Q3UM29 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Cog7Q3UM29 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Cog7Q3UM29 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Cog7Q3UM29 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Cog7Q3UM29 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Cog7Q3UM29 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Cog7Q3UM29 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Cog7Q3UM29 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Cog7Q3UM29 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Cog7Q3UM29 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Cog7Q3UM29 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Cog7Q3UM29 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Cog7Q3UM29 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Cog7Q3UM29 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Cog7Q3UM29 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Cog7Q3UM29 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Cog7Q3UM29 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Cog7Q3UM29 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Cog7Q3UM29 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Cog7Q3UM29 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Cog7Q3UM29 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Cog7Q3UM29 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Cog7Q3UM29 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Cog7Q3UM29 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Cog7Q3UM29 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Cog7Q3UM29 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Cog7Q3UM29 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Cog7Q3UM29 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Cog7Q3UM29 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Cog7Q3UM29 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Cog7Q3UM29 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Cog7Q3UM29 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Cog7Q3UM29 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Cog7Q3UM29 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Cog7Q3UM29 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Cog7Q3UM29 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Cog7Q3UM29 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Cog7Q3UM29 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Cog7Q3UM29 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Cog7Q3UM29 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Cog7Q3UM29 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Cog7Q3UM29 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Cog7Q3UM29 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Cog7Q3UM29 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Cog7Q3UM29 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Cog7Q3UM29 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Cog7Q3UM29 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Cog7Q3UM29 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cog7Q3UM29 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cog7Q3UM29 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cog7Q3UM29 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cog7Q3UM29 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cog7Q3UM29 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cog7Q3UM29 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Cog7Q3UM29 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cog7Q3UM29 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cog7Q3UM29 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cog7Q3UM29 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Cog7Q3UM29 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Cog7Q3UM29 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cog7Q3UM29 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cog7Q3UM29 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cog7Q3UM29 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cog7Q3UM29 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cog7Q3UM29 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cog7Q3UM29 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cog7Q3UM29 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.8 ms