Protein–RNA interactions for Protein: Q3ULW8

Parp3, Poly [ADP-ribose] polymerase, mousemouse

Predictions only

Length 533 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Parp3Q3ULW8 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Parp3Q3ULW8 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Parp3Q3ULW8 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Parp3Q3ULW8 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Parp3Q3ULW8 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Parp3Q3ULW8 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Parp3Q3ULW8 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Parp3Q3ULW8 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Parp3Q3ULW8 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Parp3Q3ULW8 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Parp3Q3ULW8 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Parp3Q3ULW8 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Parp3Q3ULW8 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Parp3Q3ULW8 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Parp3Q3ULW8 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Parp3Q3ULW8 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Parp3Q3ULW8 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Parp3Q3ULW8 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Parp3Q3ULW8 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Parp3Q3ULW8 Prss22-201ENSMUST00000041649 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Parp3Q3ULW8 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Parp3Q3ULW8 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Parp3Q3ULW8 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Parp3Q3ULW8 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Parp3Q3ULW8 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Parp3Q3ULW8 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Parp3Q3ULW8 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Parp3Q3ULW8 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Parp3Q3ULW8 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Parp3Q3ULW8 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Parp3Q3ULW8 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Parp3Q3ULW8 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Parp3Q3ULW8 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Parp3Q3ULW8 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Parp3Q3ULW8 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Parp3Q3ULW8 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Parp3Q3ULW8 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Parp3Q3ULW8 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Parp3Q3ULW8 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Parp3Q3ULW8 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Parp3Q3ULW8 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Parp3Q3ULW8 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Parp3Q3ULW8 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Parp3Q3ULW8 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Parp3Q3ULW8 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Parp3Q3ULW8 Gm11779-201ENSMUST00000118541 368 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Parp3Q3ULW8 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Parp3Q3ULW8 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Parp3Q3ULW8 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Parp3Q3ULW8 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Parp3Q3ULW8 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Parp3Q3ULW8 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Parp3Q3ULW8 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Parp3Q3ULW8 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Parp3Q3ULW8 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Parp3Q3ULW8 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Parp3Q3ULW8 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Parp3Q3ULW8 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Parp3Q3ULW8 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Parp3Q3ULW8 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Parp3Q3ULW8 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Parp3Q3ULW8 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Parp3Q3ULW8 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Parp3Q3ULW8 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Parp3Q3ULW8 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Parp3Q3ULW8 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Parp3Q3ULW8 Gm20878-206ENSMUST00000153997 903 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Parp3Q3ULW8 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Parp3Q3ULW8 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Parp3Q3ULW8 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Parp3Q3ULW8 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Parp3Q3ULW8 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Parp3Q3ULW8 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Parp3Q3ULW8 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Parp3Q3ULW8 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Parp3Q3ULW8 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Parp3Q3ULW8 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Parp3Q3ULW8 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Parp3Q3ULW8 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Parp3Q3ULW8 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Parp3Q3ULW8 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Parp3Q3ULW8 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Parp3Q3ULW8 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Parp3Q3ULW8 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Parp3Q3ULW8 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Parp3Q3ULW8 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Parp3Q3ULW8 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Parp3Q3ULW8 Gm15467-201ENSMUST00000120582 445 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Parp3Q3ULW8 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Parp3Q3ULW8 Btf3-204ENSMUST00000134542 780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Parp3Q3ULW8 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Parp3Q3ULW8 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Parp3Q3ULW8 Fahd2a-201ENSMUST00000028848 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Parp3Q3ULW8 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Parp3Q3ULW8 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Parp3Q3ULW8 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Parp3Q3ULW8 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Parp3Q3ULW8 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Parp3Q3ULW8 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Parp3Q3ULW8 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.2 ms