Protein–RNA interactions for Protein: Q3ULM0

Ccdc106, Coiled-coil domain-containing protein 106, mousemouse

Predictions only

Length 279 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc106Q3ULM0 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc106Q3ULM0 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc106Q3ULM0 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc106Q3ULM0 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc106Q3ULM0 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc106Q3ULM0 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc106Q3ULM0 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc106Q3ULM0 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc106Q3ULM0 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc106Q3ULM0 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc106Q3ULM0 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc106Q3ULM0 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc106Q3ULM0 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc106Q3ULM0 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc106Q3ULM0 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc106Q3ULM0 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc106Q3ULM0 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc106Q3ULM0 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc106Q3ULM0 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc106Q3ULM0 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc106Q3ULM0 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc106Q3ULM0 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc106Q3ULM0 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Ccdc106Q3ULM0 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Ccdc106Q3ULM0 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Ccdc106Q3ULM0 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Ccdc106Q3ULM0 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Ccdc106Q3ULM0 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc106Q3ULM0 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc106Q3ULM0 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc106Q3ULM0 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc106Q3ULM0 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc106Q3ULM0 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc106Q3ULM0 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc106Q3ULM0 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc106Q3ULM0 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc106Q3ULM0 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc106Q3ULM0 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc106Q3ULM0 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc106Q3ULM0 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc106Q3ULM0 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc106Q3ULM0 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc106Q3ULM0 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc106Q3ULM0 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc106Q3ULM0 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc106Q3ULM0 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc106Q3ULM0 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc106Q3ULM0 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc106Q3ULM0 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc106Q3ULM0 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc106Q3ULM0 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc106Q3ULM0 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc106Q3ULM0 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc106Q3ULM0 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc106Q3ULM0 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc106Q3ULM0 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc106Q3ULM0 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc106Q3ULM0 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc106Q3ULM0 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc106Q3ULM0 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc106Q3ULM0 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc106Q3ULM0 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc106Q3ULM0 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc106Q3ULM0 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc106Q3ULM0 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc106Q3ULM0 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc106Q3ULM0 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc106Q3ULM0 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc106Q3ULM0 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc106Q3ULM0 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc106Q3ULM0 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc106Q3ULM0 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc106Q3ULM0 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc106Q3ULM0 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc106Q3ULM0 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc106Q3ULM0 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc106Q3ULM0 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc106Q3ULM0 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc106Q3ULM0 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc106Q3ULM0 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc106Q3ULM0 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc106Q3ULM0 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc106Q3ULM0 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc106Q3ULM0 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc106Q3ULM0 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc106Q3ULM0 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc106Q3ULM0 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc106Q3ULM0 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc106Q3ULM0 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc106Q3ULM0 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc106Q3ULM0 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc106Q3ULM0 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc106Q3ULM0 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc106Q3ULM0 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc106Q3ULM0 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc106Q3ULM0 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc106Q3ULM0 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc106Q3ULM0 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc106Q3ULM0 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc106Q3ULM0 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.4 ms