Protein–RNA interactions for Protein: Q3UJV1

Ccdc61, Coiled-coil domain-containing protein 61, mousemouse

Predictions only

Length 511 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc61Q3UJV1 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ccdc61Q3UJV1 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ccdc61Q3UJV1 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ccdc61Q3UJV1 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ccdc61Q3UJV1 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Ccdc61Q3UJV1 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Ccdc61Q3UJV1 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ccdc61Q3UJV1 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Ccdc61Q3UJV1 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ccdc61Q3UJV1 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ccdc61Q3UJV1 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ccdc61Q3UJV1 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ccdc61Q3UJV1 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ccdc61Q3UJV1 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ccdc61Q3UJV1 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ccdc61Q3UJV1 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ccdc61Q3UJV1 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ccdc61Q3UJV1 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ccdc61Q3UJV1 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ccdc61Q3UJV1 Gm43356-201ENSMUST00000196582 609 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ccdc61Q3UJV1 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ccdc61Q3UJV1 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ccdc61Q3UJV1 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ccdc61Q3UJV1 AC153937.1-201ENSMUST00000218734 412 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Ccdc61Q3UJV1 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ccdc61Q3UJV1 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ccdc61Q3UJV1 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ccdc61Q3UJV1 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ccdc61Q3UJV1 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ccdc61Q3UJV1 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ccdc61Q3UJV1 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ccdc61Q3UJV1 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ccdc61Q3UJV1 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ccdc61Q3UJV1 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ccdc61Q3UJV1 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ccdc61Q3UJV1 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ccdc61Q3UJV1 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ccdc61Q3UJV1 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ccdc61Q3UJV1 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ccdc61Q3UJV1 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ccdc61Q3UJV1 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ccdc61Q3UJV1 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Ccdc61Q3UJV1 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ccdc61Q3UJV1 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ccdc61Q3UJV1 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ccdc61Q3UJV1 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Ccdc61Q3UJV1 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ccdc61Q3UJV1 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ccdc61Q3UJV1 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ccdc61Q3UJV1 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ccdc61Q3UJV1 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ccdc61Q3UJV1 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ccdc61Q3UJV1 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ccdc61Q3UJV1 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ccdc61Q3UJV1 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ccdc61Q3UJV1 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ccdc61Q3UJV1 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ccdc61Q3UJV1 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ccdc61Q3UJV1 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ccdc61Q3UJV1 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ccdc61Q3UJV1 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ccdc61Q3UJV1 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ccdc61Q3UJV1 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ccdc61Q3UJV1 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Ccdc61Q3UJV1 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ccdc61Q3UJV1 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ccdc61Q3UJV1 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ccdc61Q3UJV1 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ccdc61Q3UJV1 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Ccdc61Q3UJV1 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ccdc61Q3UJV1 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ccdc61Q3UJV1 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ccdc61Q3UJV1 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ccdc61Q3UJV1 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ccdc61Q3UJV1 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ccdc61Q3UJV1 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Ccdc61Q3UJV1 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ccdc61Q3UJV1 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ccdc61Q3UJV1 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ccdc61Q3UJV1 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Ccdc61Q3UJV1 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ccdc61Q3UJV1 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ccdc61Q3UJV1 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ccdc61Q3UJV1 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ccdc61Q3UJV1 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ccdc61Q3UJV1 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ccdc61Q3UJV1 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Ccdc61Q3UJV1 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ccdc61Q3UJV1 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ccdc61Q3UJV1 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ccdc61Q3UJV1 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ccdc61Q3UJV1 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ccdc61Q3UJV1 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Ccdc61Q3UJV1 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ccdc61Q3UJV1 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ccdc61Q3UJV1 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ccdc61Q3UJV1 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ccdc61Q3UJV1 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ccdc61Q3UJV1 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ccdc61Q3UJV1 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.4 ms