Protein–RNA interactions for Protein: Q3UIR3

Dtx3l, E3 ubiquitin-protein ligase DTX3L, mousemouse

Predictions only

Length 748 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dtx3lQ3UIR3 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Dtx3lQ3UIR3 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Dtx3lQ3UIR3 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Dtx3lQ3UIR3 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Dtx3lQ3UIR3 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Dtx3lQ3UIR3 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Dtx3lQ3UIR3 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Dtx3lQ3UIR3 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Dtx3lQ3UIR3 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Dtx3lQ3UIR3 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Dtx3lQ3UIR3 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Dtx3lQ3UIR3 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Dtx3lQ3UIR3 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Dtx3lQ3UIR3 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Dtx3lQ3UIR3 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Dtx3lQ3UIR3 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Dtx3lQ3UIR3 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Dtx3lQ3UIR3 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Dtx3lQ3UIR3 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Dtx3lQ3UIR3 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Dtx3lQ3UIR3 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Dtx3lQ3UIR3 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Dtx3lQ3UIR3 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Dtx3lQ3UIR3 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Dtx3lQ3UIR3 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Dtx3lQ3UIR3 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Dtx3lQ3UIR3 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Dtx3lQ3UIR3 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Dtx3lQ3UIR3 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Dtx3lQ3UIR3 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Dtx3lQ3UIR3 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Dtx3lQ3UIR3 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Dtx3lQ3UIR3 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Dtx3lQ3UIR3 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Dtx3lQ3UIR3 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Dtx3lQ3UIR3 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Dtx3lQ3UIR3 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Dtx3lQ3UIR3 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Dtx3lQ3UIR3 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Dtx3lQ3UIR3 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Dtx3lQ3UIR3 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Dtx3lQ3UIR3 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Dtx3lQ3UIR3 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Dtx3lQ3UIR3 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Dtx3lQ3UIR3 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Dtx3lQ3UIR3 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Dtx3lQ3UIR3 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Dtx3lQ3UIR3 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Dtx3lQ3UIR3 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Dtx3lQ3UIR3 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Dtx3lQ3UIR3 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Dtx3lQ3UIR3 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Dtx3lQ3UIR3 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Dtx3lQ3UIR3 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Dtx3lQ3UIR3 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Dtx3lQ3UIR3 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Dtx3lQ3UIR3 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Dtx3lQ3UIR3 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Dtx3lQ3UIR3 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Dtx3lQ3UIR3 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Dtx3lQ3UIR3 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Dtx3lQ3UIR3 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Dtx3lQ3UIR3 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Dtx3lQ3UIR3 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Dtx3lQ3UIR3 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Dtx3lQ3UIR3 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Dtx3lQ3UIR3 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Dtx3lQ3UIR3 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Dtx3lQ3UIR3 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Dtx3lQ3UIR3 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Dtx3lQ3UIR3 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Dtx3lQ3UIR3 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Dtx3lQ3UIR3 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Dtx3lQ3UIR3 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Dtx3lQ3UIR3 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Dtx3lQ3UIR3 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Dtx3lQ3UIR3 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Dtx3lQ3UIR3 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Dtx3lQ3UIR3 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Dtx3lQ3UIR3 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Dtx3lQ3UIR3 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Dtx3lQ3UIR3 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Dtx3lQ3UIR3 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Dtx3lQ3UIR3 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Dtx3lQ3UIR3 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Dtx3lQ3UIR3 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Dtx3lQ3UIR3 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Dtx3lQ3UIR3 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Dtx3lQ3UIR3 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Dtx3lQ3UIR3 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Dtx3lQ3UIR3 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Dtx3lQ3UIR3 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Dtx3lQ3UIR3 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Dtx3lQ3UIR3 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Dtx3lQ3UIR3 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Dtx3lQ3UIR3 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Dtx3lQ3UIR3 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Dtx3lQ3UIR3 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Dtx3lQ3UIR3 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Dtx3lQ3UIR3 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33 ms