Protein–RNA interactions for Protein: Q3UDR8

Yipf3, Protein YIPF3, mousemouse

Predictions only

Length 347 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Yipf3Q3UDR8 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Yipf3Q3UDR8 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Yipf3Q3UDR8 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Yipf3Q3UDR8 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Yipf3Q3UDR8 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Yipf3Q3UDR8 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Yipf3Q3UDR8 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Yipf3Q3UDR8 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Yipf3Q3UDR8 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Yipf3Q3UDR8 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Yipf3Q3UDR8 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Yipf3Q3UDR8 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Yipf3Q3UDR8 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Yipf3Q3UDR8 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Yipf3Q3UDR8 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Yipf3Q3UDR8 Gpr135-201ENSMUST00000050649 3150 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Yipf3Q3UDR8 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Yipf3Q3UDR8 Ccne2-207ENSMUST00000170901 3006 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Yipf3Q3UDR8 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Yipf3Q3UDR8 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Yipf3Q3UDR8 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Yipf3Q3UDR8 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Yipf3Q3UDR8 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Yipf3Q3UDR8 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Yipf3Q3UDR8 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Yipf3Q3UDR8 Map4k5-202ENSMUST00000110567 4250 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Yipf3Q3UDR8 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Yipf3Q3UDR8 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Yipf3Q3UDR8 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Yipf3Q3UDR8 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Yipf3Q3UDR8 Raf1-201ENSMUST00000000451 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Yipf3Q3UDR8 Gpd1l-204ENSMUST00000146623 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Yipf3Q3UDR8 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Yipf3Q3UDR8 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Yipf3Q3UDR8 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Yipf3Q3UDR8 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Yipf3Q3UDR8 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Yipf3Q3UDR8 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Yipf3Q3UDR8 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Yipf3Q3UDR8 Anks1b-202ENSMUST00000099366 2549 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Yipf3Q3UDR8 Ncf1-201ENSMUST00000016094 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Yipf3Q3UDR8 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Yipf3Q3UDR8 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Yipf3Q3UDR8 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Yipf3Q3UDR8 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Yipf3Q3UDR8 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Yipf3Q3UDR8 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Yipf3Q3UDR8 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Yipf3Q3UDR8 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Yipf3Q3UDR8 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Yipf3Q3UDR8 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Yipf3Q3UDR8 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Yipf3Q3UDR8 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Yipf3Q3UDR8 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Yipf3Q3UDR8 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Yipf3Q3UDR8 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Yipf3Q3UDR8 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Yipf3Q3UDR8 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Yipf3Q3UDR8 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Yipf3Q3UDR8 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Yipf3Q3UDR8 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Yipf3Q3UDR8 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Yipf3Q3UDR8 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Yipf3Q3UDR8 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Yipf3Q3UDR8 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Yipf3Q3UDR8 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Yipf3Q3UDR8 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Yipf3Q3UDR8 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Yipf3Q3UDR8 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Yipf3Q3UDR8 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Yipf3Q3UDR8 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Yipf3Q3UDR8 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Yipf3Q3UDR8 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Yipf3Q3UDR8 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Yipf3Q3UDR8 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Yipf3Q3UDR8 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Yipf3Q3UDR8 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Yipf3Q3UDR8 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Yipf3Q3UDR8 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Yipf3Q3UDR8 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Yipf3Q3UDR8 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Yipf3Q3UDR8 Gm44443-201ENSMUST00000204396 5633 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Yipf3Q3UDR8 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Yipf3Q3UDR8 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Yipf3Q3UDR8 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Yipf3Q3UDR8 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Yipf3Q3UDR8 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Yipf3Q3UDR8 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Yipf3Q3UDR8 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Yipf3Q3UDR8 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Yipf3Q3UDR8 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Yipf3Q3UDR8 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Yipf3Q3UDR8 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Yipf3Q3UDR8 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Yipf3Q3UDR8 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Yipf3Q3UDR8 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Yipf3Q3UDR8 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Yipf3Q3UDR8 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Yipf3Q3UDR8 Fam169b-201ENSMUST00000098378 2776 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Yipf3Q3UDR8 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.7 ms