Protein–RNA interactions for Protein: Q3U6N9

UPF0488 protein C8orf33 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q3U6N9 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Q3U6N9 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Q3U6N9 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Q3U6N9 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Q3U6N9 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Q3U6N9 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Q3U6N9 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Q3U6N9 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Q3U6N9 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Q3U6N9 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Q3U6N9 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Q3U6N9 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Q3U6N9 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Q3U6N9 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Q3U6N9 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Q3U6N9 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Q3U6N9 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Q3U6N9 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Q3U6N9 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Q3U6N9 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Q3U6N9 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Q3U6N9 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Q3U6N9 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Q3U6N9 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Q3U6N9 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Q3U6N9 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Q3U6N9 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Q3U6N9 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Q3U6N9 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Q3U6N9 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Q3U6N9 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Q3U6N9 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Q3U6N9 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Q3U6N9 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Q3U6N9 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Q3U6N9 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Q3U6N9 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Q3U6N9 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Q3U6N9 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Q3U6N9 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Q3U6N9 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Q3U6N9 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Q3U6N9 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Q3U6N9 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Q3U6N9 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Q3U6N9 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Q3U6N9 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Q3U6N9 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Q3U6N9 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Q3U6N9 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Q3U6N9 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Q3U6N9 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Q3U6N9 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Q3U6N9 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Q3U6N9 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Q3U6N9 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Q3U6N9 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Q3U6N9 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Q3U6N9 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Q3U6N9 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Q3U6N9 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Q3U6N9 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Q3U6N9 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Q3U6N9 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Q3U6N9 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Q3U6N9 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Q3U6N9 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Q3U6N9 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Q3U6N9 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Q3U6N9 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Q3U6N9 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Q3U6N9 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Q3U6N9 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Q3U6N9 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Q3U6N9 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Q3U6N9 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Q3U6N9 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Q3U6N9 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Q3U6N9 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Q3U6N9 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Q3U6N9 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Q3U6N9 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Q3U6N9 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Q3U6N9 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Q3U6N9 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Q3U6N9 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Q3U6N9 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Q3U6N9 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Q3U6N9 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Q3U6N9 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Q3U6N9 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Q3U6N9 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Q3U6N9 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Q3U6N9 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Q3U6N9 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Q3U6N9 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Q3U6N9 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Q3U6N9 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Q3U6N9 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Q3U6N9 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.5 ms