Protein–RNA interactions for Protein: Q3U3E2

Fam117b, Protein FAM117B, mousemouse

Predictions only

Length 584 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam117bQ3U3E2 Gm20821-201ENSMUST00000179829 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Fam117bQ3U3E2 Gm26871-201ENSMUST00000180593 700 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Fam117bQ3U3E2 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Fam117bQ3U3E2 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Fam117bQ3U3E2 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Fam117bQ3U3E2 Gm38000-201ENSMUST00000192390 1215 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Fam117bQ3U3E2 Gm38280-201ENSMUST00000192610 158 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Fam117bQ3U3E2 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Fam117bQ3U3E2 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Fam117bQ3U3E2 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Fam117bQ3U3E2 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Fam117bQ3U3E2 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Fam117bQ3U3E2 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Fam117bQ3U3E2 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Fam117bQ3U3E2 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Fam117bQ3U3E2 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Fam117bQ3U3E2 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Fam117bQ3U3E2 Dlg4-201ENSMUST00000018700 3204 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Fam117bQ3U3E2 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Fam117bQ3U3E2 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Fam117bQ3U3E2 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Fam117bQ3U3E2 Gm45175-201ENSMUST00000208295 1375 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Fam117bQ3U3E2 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Fam117bQ3U3E2 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Fam117bQ3U3E2 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Fam117bQ3U3E2 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Fam117bQ3U3E2 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Fam117bQ3U3E2 Gm28180-201ENSMUST00000189608 722 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Fam117bQ3U3E2 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Fam117bQ3U3E2 Gm18660-201ENSMUST00000199542 629 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Fam117bQ3U3E2 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Fam117bQ3U3E2 Gm44799-201ENSMUST00000207639 1202 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Fam117bQ3U3E2 Tas2r113-201ENSMUST00000079035 930 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Fam117bQ3U3E2 Krtap9-1-201ENSMUST00000093936 1044 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Fam117bQ3U3E2 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Fam117bQ3U3E2 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Fam117bQ3U3E2 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Fam117bQ3U3E2 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Fam117bQ3U3E2 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Fam117bQ3U3E2 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Fam117bQ3U3E2 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Fam117bQ3U3E2 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Fam117bQ3U3E2 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Fam117bQ3U3E2 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Fam117bQ3U3E2 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Fam117bQ3U3E2 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Fam117bQ3U3E2 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Fam117bQ3U3E2 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Fam117bQ3U3E2 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Fam117bQ3U3E2 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Fam117bQ3U3E2 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Fam117bQ3U3E2 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Fam117bQ3U3E2 Gm6938-201ENSMUST00000123014 771 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Fam117bQ3U3E2 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Fam117bQ3U3E2 Gm5277-201ENSMUST00000164923 556 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Fam117bQ3U3E2 2810404M03Rik-201ENSMUST00000188324 1245 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Fam117bQ3U3E2 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Fam117bQ3U3E2 AC153968.2-201ENSMUST00000215579 1140 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Fam117bQ3U3E2 Olfr1275-201ENSMUST00000099620 1020 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Fam117bQ3U3E2 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Fam117bQ3U3E2 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Fam117bQ3U3E2 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Fam117bQ3U3E2 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Fam117bQ3U3E2 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Fam117bQ3U3E2 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Fam117bQ3U3E2 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Fam117bQ3U3E2 Gm42941-201ENSMUST00000200347 1321 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Fam117bQ3U3E2 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Fam117bQ3U3E2 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Fam117bQ3U3E2 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Fam117bQ3U3E2 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Fam117bQ3U3E2 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Fam117bQ3U3E2 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Fam117bQ3U3E2 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Fam117bQ3U3E2 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Fam117bQ3U3E2 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Fam117bQ3U3E2 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Fam117bQ3U3E2 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Fam117bQ3U3E2 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Fam117bQ3U3E2 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Fam117bQ3U3E2 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Fam117bQ3U3E2 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Fam117bQ3U3E2 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Fam117bQ3U3E2 Gm14233-201ENSMUST00000149576 439 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Fam117bQ3U3E2 Gm43124-201ENSMUST00000201878 278 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Fam117bQ3U3E2 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Fam117bQ3U3E2 AC160060.2-201ENSMUST00000220151 811 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Fam117bQ3U3E2 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Fam117bQ3U3E2 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Fam117bQ3U3E2 Olfr619-201ENSMUST00000098196 1124 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Fam117bQ3U3E2 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Fam117bQ3U3E2 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Fam117bQ3U3E2 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Fam117bQ3U3E2 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Fam117bQ3U3E2 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Fam117bQ3U3E2 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Fam117bQ3U3E2 Tnf-201ENSMUST00000025263 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Fam117bQ3U3E2 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Fam117bQ3U3E2 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Fam117bQ3U3E2 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.5 ms