Protein–RNA interactions for Protein: Q3U213

Serac1, Protein SERAC1, mousemouse

Predictions only

Length 654 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Serac1Q3U213 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Serac1Q3U213 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Serac1Q3U213 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Serac1Q3U213 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Serac1Q3U213 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Serac1Q3U213 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Serac1Q3U213 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Serac1Q3U213 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Serac1Q3U213 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Serac1Q3U213 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Serac1Q3U213 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Serac1Q3U213 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Serac1Q3U213 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Serac1Q3U213 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Serac1Q3U213 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Serac1Q3U213 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Serac1Q3U213 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Serac1Q3U213 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Serac1Q3U213 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Serac1Q3U213 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Serac1Q3U213 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Serac1Q3U213 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Serac1Q3U213 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Serac1Q3U213 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Serac1Q3U213 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Serac1Q3U213 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Serac1Q3U213 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Serac1Q3U213 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Serac1Q3U213 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Serac1Q3U213 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Serac1Q3U213 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Serac1Q3U213 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Serac1Q3U213 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Serac1Q3U213 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Serac1Q3U213 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Serac1Q3U213 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Serac1Q3U213 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Serac1Q3U213 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Serac1Q3U213 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Serac1Q3U213 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Serac1Q3U213 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Serac1Q3U213 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Serac1Q3U213 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.38
Serac1Q3U213 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Serac1Q3U213 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.38
Serac1Q3U213 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Serac1Q3U213 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Serac1Q3U213 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Serac1Q3U213 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Serac1Q3U213 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Serac1Q3U213 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Serac1Q3U213 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Serac1Q3U213 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Serac1Q3U213 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Serac1Q3U213 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Serac1Q3U213 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Serac1Q3U213 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Serac1Q3U213 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Serac1Q3U213 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Serac1Q3U213 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Serac1Q3U213 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Serac1Q3U213 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Serac1Q3U213 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Serac1Q3U213 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Serac1Q3U213 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Serac1Q3U213 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Serac1Q3U213 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Serac1Q3U213 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Serac1Q3U213 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Serac1Q3U213 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Serac1Q3U213 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Serac1Q3U213 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Serac1Q3U213 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Serac1Q3U213 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Serac1Q3U213 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Serac1Q3U213 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Serac1Q3U213 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Serac1Q3U213 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Serac1Q3U213 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Serac1Q3U213 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Serac1Q3U213 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Serac1Q3U213 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Serac1Q3U213 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Serac1Q3U213 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Serac1Q3U213 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Serac1Q3U213 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Serac1Q3U213 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Serac1Q3U213 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Serac1Q3U213 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Serac1Q3U213 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Serac1Q3U213 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Serac1Q3U213 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Serac1Q3U213 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Serac1Q3U213 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Serac1Q3U213 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Serac1Q3U213 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Serac1Q3U213 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Serac1Q3U213 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Serac1Q3U213 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Serac1Q3U213 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.6 ms