Protein–RNA interactions for Protein: Q3U155

Ccdc174, Coiled-coil domain-containing protein 174, mousemouse

Predictions only

Length 467 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc174Q3U155 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Ccdc174Q3U155 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Ccdc174Q3U155 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Ccdc174Q3U155 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Ccdc174Q3U155 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Ccdc174Q3U155 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Ccdc174Q3U155 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Ccdc174Q3U155 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Ccdc174Q3U155 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Ccdc174Q3U155 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Ccdc174Q3U155 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Ccdc174Q3U155 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
Ccdc174Q3U155 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
Ccdc174Q3U155 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Ccdc174Q3U155 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Ccdc174Q3U155 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Ccdc174Q3U155 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Ccdc174Q3U155 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Ccdc174Q3U155 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Ccdc174Q3U155 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Ccdc174Q3U155 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Ccdc174Q3U155 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Ccdc174Q3U155 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Ccdc174Q3U155 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ccdc174Q3U155 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ccdc174Q3U155 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ccdc174Q3U155 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ccdc174Q3U155 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ccdc174Q3U155 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
Ccdc174Q3U155 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ccdc174Q3U155 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
Ccdc174Q3U155 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ccdc174Q3U155 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ccdc174Q3U155 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ccdc174Q3U155 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ccdc174Q3U155 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
Ccdc174Q3U155 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ccdc174Q3U155 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ccdc174Q3U155 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Ccdc174Q3U155 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Ccdc174Q3U155 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Ccdc174Q3U155 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Ccdc174Q3U155 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Ccdc174Q3U155 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Ccdc174Q3U155 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Ccdc174Q3U155 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Ccdc174Q3U155 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Ccdc174Q3U155 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Ccdc174Q3U155 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Ccdc174Q3U155 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Ccdc174Q3U155 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Ccdc174Q3U155 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Ccdc174Q3U155 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC19.52■□□□□ 0.71
Ccdc174Q3U155 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Ccdc174Q3U155 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Ccdc174Q3U155 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Ccdc174Q3U155 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ccdc174Q3U155 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ccdc174Q3U155 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ccdc174Q3U155 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ccdc174Q3U155 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ccdc174Q3U155 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ccdc174Q3U155 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ccdc174Q3U155 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ccdc174Q3U155 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ccdc174Q3U155 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ccdc174Q3U155 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ccdc174Q3U155 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ccdc174Q3U155 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ccdc174Q3U155 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
Ccdc174Q3U155 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ccdc174Q3U155 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ccdc174Q3U155 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ccdc174Q3U155 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ccdc174Q3U155 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ccdc174Q3U155 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ccdc174Q3U155 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ccdc174Q3U155 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ccdc174Q3U155 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ccdc174Q3U155 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ccdc174Q3U155 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Ccdc174Q3U155 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Ccdc174Q3U155 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Ccdc174Q3U155 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Ccdc174Q3U155 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Ccdc174Q3U155 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Ccdc174Q3U155 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Ccdc174Q3U155 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Ccdc174Q3U155 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Ccdc174Q3U155 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Ccdc174Q3U155 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Ccdc174Q3U155 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Ccdc174Q3U155 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Ccdc174Q3U155 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Ccdc174Q3U155 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Ccdc174Q3U155 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Ccdc174Q3U155 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Ccdc174Q3U155 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Ccdc174Q3U155 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Ccdc174Q3U155 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35 ms