Protein–RNA interactions for Protein: Q3U0Y2

Tmem35b, Transmembrane protein 35B, mousemouse

Predictions only

Length 150 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem35bQ3U0Y2 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Tmem35bQ3U0Y2 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tmem35bQ3U0Y2 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tmem35bQ3U0Y2 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tmem35bQ3U0Y2 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tmem35bQ3U0Y2 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tmem35bQ3U0Y2 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tmem35bQ3U0Y2 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tmem35bQ3U0Y2 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tmem35bQ3U0Y2 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tmem35bQ3U0Y2 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tmem35bQ3U0Y2 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tmem35bQ3U0Y2 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tmem35bQ3U0Y2 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tmem35bQ3U0Y2 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tmem35bQ3U0Y2 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tmem35bQ3U0Y2 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tmem35bQ3U0Y2 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tmem35bQ3U0Y2 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tmem35bQ3U0Y2 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tmem35bQ3U0Y2 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tmem35bQ3U0Y2 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Tmem35bQ3U0Y2 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Tmem35bQ3U0Y2 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tmem35bQ3U0Y2 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tmem35bQ3U0Y2 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tmem35bQ3U0Y2 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tmem35bQ3U0Y2 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tmem35bQ3U0Y2 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tmem35bQ3U0Y2 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tmem35bQ3U0Y2 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tmem35bQ3U0Y2 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tmem35bQ3U0Y2 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tmem35bQ3U0Y2 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tmem35bQ3U0Y2 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tmem35bQ3U0Y2 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tmem35bQ3U0Y2 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tmem35bQ3U0Y2 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tmem35bQ3U0Y2 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tmem35bQ3U0Y2 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tmem35bQ3U0Y2 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Tmem35bQ3U0Y2 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Tmem35bQ3U0Y2 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tmem35bQ3U0Y2 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tmem35bQ3U0Y2 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tmem35bQ3U0Y2 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tmem35bQ3U0Y2 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tmem35bQ3U0Y2 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tmem35bQ3U0Y2 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tmem35bQ3U0Y2 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tmem35bQ3U0Y2 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tmem35bQ3U0Y2 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tmem35bQ3U0Y2 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tmem35bQ3U0Y2 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tmem35bQ3U0Y2 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tmem35bQ3U0Y2 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tmem35bQ3U0Y2 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tmem35bQ3U0Y2 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tmem35bQ3U0Y2 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tmem35bQ3U0Y2 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Tmem35bQ3U0Y2 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tmem35bQ3U0Y2 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tmem35bQ3U0Y2 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tmem35bQ3U0Y2 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tmem35bQ3U0Y2 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tmem35bQ3U0Y2 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tmem35bQ3U0Y2 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tmem35bQ3U0Y2 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tmem35bQ3U0Y2 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tmem35bQ3U0Y2 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tmem35bQ3U0Y2 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Tmem35bQ3U0Y2 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tmem35bQ3U0Y2 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tmem35bQ3U0Y2 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tmem35bQ3U0Y2 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tmem35bQ3U0Y2 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tmem35bQ3U0Y2 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tmem35bQ3U0Y2 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tmem35bQ3U0Y2 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tmem35bQ3U0Y2 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Tmem35bQ3U0Y2 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Tmem35bQ3U0Y2 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Tmem35bQ3U0Y2 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Tmem35bQ3U0Y2 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Tmem35bQ3U0Y2 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Tmem35bQ3U0Y2 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Tmem35bQ3U0Y2 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Tmem35bQ3U0Y2 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Tmem35bQ3U0Y2 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Tmem35bQ3U0Y2 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tmem35bQ3U0Y2 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tmem35bQ3U0Y2 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tmem35bQ3U0Y2 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tmem35bQ3U0Y2 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tmem35bQ3U0Y2 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tmem35bQ3U0Y2 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tmem35bQ3U0Y2 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tmem35bQ3U0Y2 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tmem35bQ3U0Y2 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Tmem35bQ3U0Y2 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.8 ms