Protein–RNA interactions for Protein: Q3TZI6

Ccnj, Cyclin-J, mousemouse

Predictions only

Length 379 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CcnjQ3TZI6 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CcnjQ3TZI6 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CcnjQ3TZI6 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CcnjQ3TZI6 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CcnjQ3TZI6 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CcnjQ3TZI6 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CcnjQ3TZI6 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CcnjQ3TZI6 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CcnjQ3TZI6 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
CcnjQ3TZI6 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
CcnjQ3TZI6 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CcnjQ3TZI6 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CcnjQ3TZI6 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CcnjQ3TZI6 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
CcnjQ3TZI6 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CcnjQ3TZI6 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
CcnjQ3TZI6 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CcnjQ3TZI6 Ralbp1-201ENSMUST00000024905 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CcnjQ3TZI6 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CcnjQ3TZI6 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
CcnjQ3TZI6 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
CcnjQ3TZI6 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CcnjQ3TZI6 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CcnjQ3TZI6 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CcnjQ3TZI6 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CcnjQ3TZI6 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CcnjQ3TZI6 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.05
CcnjQ3TZI6 Slc39a11-203ENSMUST00000106633 2688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CcnjQ3TZI6 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CcnjQ3TZI6 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
CcnjQ3TZI6 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CcnjQ3TZI6 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CcnjQ3TZI6 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
CcnjQ3TZI6 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CcnjQ3TZI6 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CcnjQ3TZI6 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CcnjQ3TZI6 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
CcnjQ3TZI6 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
CcnjQ3TZI6 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
CcnjQ3TZI6 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CcnjQ3TZI6 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.05
CcnjQ3TZI6 Pgm2-201ENSMUST00000058351 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CcnjQ3TZI6 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CcnjQ3TZI6 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CcnjQ3TZI6 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CcnjQ3TZI6 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
CcnjQ3TZI6 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
CcnjQ3TZI6 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC14.71□□□□□ -0.06
CcnjQ3TZI6 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
CcnjQ3TZI6 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
CcnjQ3TZI6 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CcnjQ3TZI6 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CcnjQ3TZI6 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CcnjQ3TZI6 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CcnjQ3TZI6 Tchh-201ENSMUST00000064257 5823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CcnjQ3TZI6 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CcnjQ3TZI6 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CcnjQ3TZI6 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CcnjQ3TZI6 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CcnjQ3TZI6 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CcnjQ3TZI6 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CcnjQ3TZI6 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CcnjQ3TZI6 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CcnjQ3TZI6 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CcnjQ3TZI6 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CcnjQ3TZI6 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CcnjQ3TZI6 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CcnjQ3TZI6 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CcnjQ3TZI6 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CcnjQ3TZI6 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CcnjQ3TZI6 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CcnjQ3TZI6 Timp2-201ENSMUST00000017610 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CcnjQ3TZI6 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CcnjQ3TZI6 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CcnjQ3TZI6 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CcnjQ3TZI6 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CcnjQ3TZI6 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CcnjQ3TZI6 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CcnjQ3TZI6 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CcnjQ3TZI6 Adgrl1-210ENSMUST00000152978 5734 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CcnjQ3TZI6 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CcnjQ3TZI6 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CcnjQ3TZI6 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CcnjQ3TZI6 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CcnjQ3TZI6 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CcnjQ3TZI6 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CcnjQ3TZI6 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CcnjQ3TZI6 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CcnjQ3TZI6 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CcnjQ3TZI6 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CcnjQ3TZI6 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CcnjQ3TZI6 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CcnjQ3TZI6 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CcnjQ3TZI6 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CcnjQ3TZI6 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CcnjQ3TZI6 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CcnjQ3TZI6 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CcnjQ3TZI6 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CcnjQ3TZI6 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CcnjQ3TZI6 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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