Protein–RNA interactions for Protein: Q3TTL0

Uncharacterized protein C3orf38 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 348 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q3TTL0 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Q3TTL0 Gm15492-201ENSMUST00000156734 606 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Q3TTL0 Cox6c-205ENSMUST00000156915 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Q3TTL0 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Q3TTL0 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Q3TTL0 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Q3TTL0 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Q3TTL0 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Q3TTL0 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Q3TTL0 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Q3TTL0 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Q3TTL0 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Q3TTL0 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Q3TTL0 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Q3TTL0 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Q3TTL0 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Q3TTL0 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Q3TTL0 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Q3TTL0 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Q3TTL0 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Q3TTL0 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Q3TTL0 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Q3TTL0 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Q3TTL0 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Q3TTL0 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Q3TTL0 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Q3TTL0 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Q3TTL0 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Q3TTL0 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Q3TTL0 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Q3TTL0 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Q3TTL0 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Q3TTL0 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Q3TTL0 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Q3TTL0 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Q3TTL0 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Q3TTL0 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Q3TTL0 AC132104.2-201ENSMUST00000215011 266 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Q3TTL0 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Q3TTL0 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Q3TTL0 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Q3TTL0 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Q3TTL0 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Q3TTL0 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Q3TTL0 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Q3TTL0 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Q3TTL0 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Q3TTL0 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Q3TTL0 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Q3TTL0 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Q3TTL0 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Q3TTL0 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Q3TTL0 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Q3TTL0 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Q3TTL0 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Q3TTL0 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Q3TTL0 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Q3TTL0 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Q3TTL0 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Q3TTL0 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Q3TTL0 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Q3TTL0 Gm27525-201ENSMUST00000184465 107 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Q3TTL0 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Q3TTL0 Gm37935-201ENSMUST00000192012 982 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Q3TTL0 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Q3TTL0 Gm5712-201ENSMUST00000199748 1043 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Q3TTL0 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Q3TTL0 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Q3TTL0 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Q3TTL0 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Q3TTL0 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Q3TTL0 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Q3TTL0 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Q3TTL0 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Q3TTL0 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Q3TTL0 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Q3TTL0 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Q3TTL0 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Q3TTL0 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Q3TTL0 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Q3TTL0 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Q3TTL0 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Q3TTL0 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Q3TTL0 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Q3TTL0 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Q3TTL0 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Q3TTL0 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Q3TTL0 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Q3TTL0 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Q3TTL0 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Q3TTL0 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Q3TTL0 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Q3TTL0 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Q3TTL0 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Q3TTL0 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Q3TTL0 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Q3TTL0 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Q3TTL0 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Q3TTL0 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Q3TTL0 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.8 ms