Protein–RNA interactions for Protein: Q3TQ03

Ciart, Circadian-associated transcriptional repressor, mousemouse

Predictions only

Length 375 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CiartQ3TQ03 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CiartQ3TQ03 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CiartQ3TQ03 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CiartQ3TQ03 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CiartQ3TQ03 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CiartQ3TQ03 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CiartQ3TQ03 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CiartQ3TQ03 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CiartQ3TQ03 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CiartQ3TQ03 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CiartQ3TQ03 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CiartQ3TQ03 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CiartQ3TQ03 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CiartQ3TQ03 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CiartQ3TQ03 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CiartQ3TQ03 Prss45-202ENSMUST00000146794 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CiartQ3TQ03 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CiartQ3TQ03 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
CiartQ3TQ03 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CiartQ3TQ03 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CiartQ3TQ03 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CiartQ3TQ03 Pdlim4-202ENSMUST00000093109 962 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CiartQ3TQ03 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CiartQ3TQ03 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CiartQ3TQ03 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CiartQ3TQ03 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CiartQ3TQ03 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CiartQ3TQ03 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CiartQ3TQ03 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CiartQ3TQ03 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CiartQ3TQ03 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CiartQ3TQ03 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CiartQ3TQ03 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CiartQ3TQ03 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CiartQ3TQ03 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CiartQ3TQ03 Commd6-201ENSMUST00000100339 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CiartQ3TQ03 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CiartQ3TQ03 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CiartQ3TQ03 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CiartQ3TQ03 Mpc1-205ENSMUST00000142594 961 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CiartQ3TQ03 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CiartQ3TQ03 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CiartQ3TQ03 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
CiartQ3TQ03 Rbpms-202ENSMUST00000033995 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CiartQ3TQ03 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CiartQ3TQ03 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CiartQ3TQ03 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CiartQ3TQ03 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CiartQ3TQ03 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CiartQ3TQ03 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CiartQ3TQ03 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CiartQ3TQ03 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CiartQ3TQ03 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CiartQ3TQ03 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CiartQ3TQ03 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CiartQ3TQ03 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
CiartQ3TQ03 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CiartQ3TQ03 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
CiartQ3TQ03 Gm11779-201ENSMUST00000118541 368 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
CiartQ3TQ03 Gm5264-201ENSMUST00000190584 848 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
CiartQ3TQ03 Abhd18-206ENSMUST00000203650 797 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CiartQ3TQ03 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CiartQ3TQ03 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CiartQ3TQ03 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CiartQ3TQ03 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
CiartQ3TQ03 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CiartQ3TQ03 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CiartQ3TQ03 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CiartQ3TQ03 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CiartQ3TQ03 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CiartQ3TQ03 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CiartQ3TQ03 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CiartQ3TQ03 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CiartQ3TQ03 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CiartQ3TQ03 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CiartQ3TQ03 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CiartQ3TQ03 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CiartQ3TQ03 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CiartQ3TQ03 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CiartQ3TQ03 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CiartQ3TQ03 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CiartQ3TQ03 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CiartQ3TQ03 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CiartQ3TQ03 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
CiartQ3TQ03 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CiartQ3TQ03 Tex30-206ENSMUST00000133677 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CiartQ3TQ03 Gm20878-206ENSMUST00000153997 903 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CiartQ3TQ03 Gm16160-201ENSMUST00000160105 781 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CiartQ3TQ03 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CiartQ3TQ03 Gm7230-201ENSMUST00000173026 815 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
CiartQ3TQ03 Gm4535-201ENSMUST00000182274 558 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
CiartQ3TQ03 Gm44107-201ENSMUST00000203242 573 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CiartQ3TQ03 5830454E08Rik-202ENSMUST00000213974 744 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
CiartQ3TQ03 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
CiartQ3TQ03 Rangrf-201ENSMUST00000038644 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CiartQ3TQ03 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CiartQ3TQ03 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CiartQ3TQ03 Gm10355-201ENSMUST00000097146 517 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
CiartQ3TQ03 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
CiartQ3TQ03 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.5 ms