Protein–RNA interactions for Protein: Q3TMP1

Gtf3c3, General transcription factor IIIC, polypeptide 3, mousemouse

Predictions only

Length 882 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf3c3Q3TMP1 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Gtf3c3Q3TMP1 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Gtf3c3Q3TMP1 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Gtf3c3Q3TMP1 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Gtf3c3Q3TMP1 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Gtf3c3Q3TMP1 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Gtf3c3Q3TMP1 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Gtf3c3Q3TMP1 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Gtf3c3Q3TMP1 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Gtf3c3Q3TMP1 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Gtf3c3Q3TMP1 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Gtf3c3Q3TMP1 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Gtf3c3Q3TMP1 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Gtf3c3Q3TMP1 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Gtf3c3Q3TMP1 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Gtf3c3Q3TMP1 Ss18-201ENSMUST00000040924 3090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Gtf3c3Q3TMP1 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Gtf3c3Q3TMP1 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Gtf3c3Q3TMP1 Tbc1d22b-201ENSMUST00000048677 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Gtf3c3Q3TMP1 Tmem185b-202ENSMUST00000183952 2824 ntAPPRIS P1 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Gtf3c3Q3TMP1 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Gtf3c3Q3TMP1 Mcidas-201ENSMUST00000092089 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Gtf3c3Q3TMP1 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Gtf3c3Q3TMP1 Slc7a7-209ENSMUST00000226753 2126 ntAPPRIS P1 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Gtf3c3Q3TMP1 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Gtf3c3Q3TMP1 Evx1os-201ENSMUST00000125305 2916 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Gtf3c3Q3TMP1 Fam167a-201ENSMUST00000121288 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Gtf3c3Q3TMP1 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Gtf3c3Q3TMP1 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Gtf3c3Q3TMP1 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Gtf3c3Q3TMP1 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Gtf3c3Q3TMP1 Rbfox3-201ENSMUST00000017576 3150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Gtf3c3Q3TMP1 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Gtf3c3Q3TMP1 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Gtf3c3Q3TMP1 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Gtf3c3Q3TMP1 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Gtf3c3Q3TMP1 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Gtf3c3Q3TMP1 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Gtf3c3Q3TMP1 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Gtf3c3Q3TMP1 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Gtf3c3Q3TMP1 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Gtf3c3Q3TMP1 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Gtf3c3Q3TMP1 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Gtf3c3Q3TMP1 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Gtf3c3Q3TMP1 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Gtf3c3Q3TMP1 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Gtf3c3Q3TMP1 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Gtf3c3Q3TMP1 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Gtf3c3Q3TMP1 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Gtf3c3Q3TMP1 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Gtf3c3Q3TMP1 9630013D21Rik-204ENSMUST00000156790 3096 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Gtf3c3Q3TMP1 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Gtf3c3Q3TMP1 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Gtf3c3Q3TMP1 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Gtf3c3Q3TMP1 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Gtf3c3Q3TMP1 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Gtf3c3Q3TMP1 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Gtf3c3Q3TMP1 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Gtf3c3Q3TMP1 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Gtf3c3Q3TMP1 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Gtf3c3Q3TMP1 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Gtf3c3Q3TMP1 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Gtf3c3Q3TMP1 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Gtf3c3Q3TMP1 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Gtf3c3Q3TMP1 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Gtf3c3Q3TMP1 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Gtf3c3Q3TMP1 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Gtf3c3Q3TMP1 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Gtf3c3Q3TMP1 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Gtf3c3Q3TMP1 Irf3-201ENSMUST00000003284 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Gtf3c3Q3TMP1 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Gtf3c3Q3TMP1 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Gtf3c3Q3TMP1 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Gtf3c3Q3TMP1 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Gtf3c3Q3TMP1 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Gtf3c3Q3TMP1 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Gtf3c3Q3TMP1 Gm10676-201ENSMUST00000098778 3221 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Gtf3c3Q3TMP1 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Gtf3c3Q3TMP1 Ubc-203ENSMUST00000156249 2581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Gtf3c3Q3TMP1 Gpr88-201ENSMUST00000090473 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Gtf3c3Q3TMP1 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Gtf3c3Q3TMP1 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Gtf3c3Q3TMP1 Nyap1-204ENSMUST00000212152 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Gtf3c3Q3TMP1 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Gtf3c3Q3TMP1 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Gtf3c3Q3TMP1 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Gtf3c3Q3TMP1 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Gtf3c3Q3TMP1 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Gtf3c3Q3TMP1 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Gtf3c3Q3TMP1 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Gtf3c3Q3TMP1 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Gtf3c3Q3TMP1 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Gtf3c3Q3TMP1 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Gtf3c3Q3TMP1 Tle1-203ENSMUST00000074216 4369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Gtf3c3Q3TMP1 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Gtf3c3Q3TMP1 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Gtf3c3Q3TMP1 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Gtf3c3Q3TMP1 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Gtf3c3Q3TMP1 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Gtf3c3Q3TMP1 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.2 ms