Protein–RNA interactions for Protein: Q3TKT4

Smarca4, Transcription activator BRG1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,613 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smarca4Q3TKT4 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Smarca4Q3TKT4 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
Smarca4Q3TKT4 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Smarca4Q3TKT4 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Smarca4Q3TKT4 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Smarca4Q3TKT4 Gm44872-201ENSMUST00000207864 420 ntBASIC28.78■■■□□ 2.2
Smarca4Q3TKT4 Lin37-201ENSMUST00000043975 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Smarca4Q3TKT4 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Smarca4Q3TKT4 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
Smarca4Q3TKT4 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Smarca4Q3TKT4 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Smarca4Q3TKT4 Tspan31-201ENSMUST00000060991 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Smarca4Q3TKT4 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Smarca4Q3TKT4 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Smarca4Q3TKT4 Nckipsd-206ENSMUST00000195323 467 ntTSL 3 BASIC28.77■■■□□ 2.2
Smarca4Q3TKT4 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
Smarca4Q3TKT4 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Smarca4Q3TKT4 Eif5-201ENSMUST00000050993 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Smarca4Q3TKT4 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Smarca4Q3TKT4 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Smarca4Q3TKT4 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Smarca4Q3TKT4 1700003M07Rik-202ENSMUST00000147634 564 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.2
Smarca4Q3TKT4 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.2
Smarca4Q3TKT4 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.2
Smarca4Q3TKT4 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
Smarca4Q3TKT4 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
Smarca4Q3TKT4 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
Smarca4Q3TKT4 Gm37171-201ENSMUST00000192636 1185 ntBASIC28.76■■■□□ 2.19
Smarca4Q3TKT4 Sdhc-201ENSMUST00000081560 815 ntTSL 3 BASIC28.76■■■□□ 2.19
Smarca4Q3TKT4 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Smarca4Q3TKT4 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Smarca4Q3TKT4 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Smarca4Q3TKT4 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC28.75■■■□□ 2.19
Smarca4Q3TKT4 Gm11455-201ENSMUST00000149285 733 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Smarca4Q3TKT4 Gm20680-201ENSMUST00000176881 789 ntTSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
Smarca4Q3TKT4 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Smarca4Q3TKT4 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
Smarca4Q3TKT4 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC28.75■■■□□ 2.19
Smarca4Q3TKT4 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Smarca4Q3TKT4 P2rx6-203ENSMUST00000171002 1353 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Smarca4Q3TKT4 Acp5-201ENSMUST00000069330 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Smarca4Q3TKT4 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Smarca4Q3TKT4 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
Smarca4Q3TKT4 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Smarca4Q3TKT4 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Smarca4Q3TKT4 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Smarca4Q3TKT4 Spr-ps1-202ENSMUST00000186281 706 ntTSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
Smarca4Q3TKT4 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Smarca4Q3TKT4 Stk33-203ENSMUST00000121378 1304 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Smarca4Q3TKT4 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Smarca4Q3TKT4 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Smarca4Q3TKT4 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Smarca4Q3TKT4 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Smarca4Q3TKT4 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Smarca4Q3TKT4 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Smarca4Q3TKT4 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Smarca4Q3TKT4 Gm13616-201ENSMUST00000120600 222 ntBASIC28.73■■■□□ 2.19
Smarca4Q3TKT4 Gm11025-201ENSMUST00000140773 466 ntBASIC28.73■■■□□ 2.19
Smarca4Q3TKT4 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Smarca4Q3TKT4 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC28.73■■■□□ 2.19
Smarca4Q3TKT4 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Smarca4Q3TKT4 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Smarca4Q3TKT4 Hmgcl-201ENSMUST00000030432 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Smarca4Q3TKT4 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.73■■■□□ 2.19
Smarca4Q3TKT4 Gm16151-201ENSMUST00000129696 639 ntTSL 3 BASIC28.72■■■□□ 2.19
Smarca4Q3TKT4 Lce1b-201ENSMUST00000029531 647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Smarca4Q3TKT4 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC28.72■■■□□ 2.19
Smarca4Q3TKT4 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Smarca4Q3TKT4 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Smarca4Q3TKT4 Tmed1-201ENSMUST00000034698 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Smarca4Q3TKT4 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Smarca4Q3TKT4 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Smarca4Q3TKT4 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Smarca4Q3TKT4 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Smarca4Q3TKT4 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC28.72■■■□□ 2.19
Smarca4Q3TKT4 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
Smarca4Q3TKT4 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
Smarca4Q3TKT4 Npb-201ENSMUST00000061309 418 ntTSL 3 BASIC28.72■■■□□ 2.19
Smarca4Q3TKT4 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Smarca4Q3TKT4 4933434E20Rik-204ENSMUST00000159064 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Smarca4Q3TKT4 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
Smarca4Q3TKT4 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Smarca4Q3TKT4 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Smarca4Q3TKT4 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Smarca4Q3TKT4 Dio1-202ENSMUST00000106748 396 ntTSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
Smarca4Q3TKT4 Ern1-202ENSMUST00000106799 660 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Smarca4Q3TKT4 Arpp19-210ENSMUST00000170308 429 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
Smarca4Q3TKT4 1700030N18Rik-201ENSMUST00000202497 966 ntBASIC28.71■■■□□ 2.19
Smarca4Q3TKT4 Gm30684-201ENSMUST00000205632 600 ntTSL 3 BASIC28.71■■■□□ 2.19
Smarca4Q3TKT4 Tspyl-ps-201ENSMUST00000220692 1117 ntBASIC28.71■■■□□ 2.19
Smarca4Q3TKT4 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
Smarca4Q3TKT4 Ltc4s-202ENSMUST00000102772 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
Smarca4Q3TKT4 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC28.7■■■□□ 2.19
Smarca4Q3TKT4 Gm27300-201ENSMUST00000184085 97 ntBASIC28.7■■■□□ 2.19
Smarca4Q3TKT4 Gm27335-201ENSMUST00000184758 97 ntBASIC28.7■■■□□ 2.19
Smarca4Q3TKT4 Timm13-201ENSMUST00000020440 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
Smarca4Q3TKT4 Rpl28-201ENSMUST00000032597 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
Smarca4Q3TKT4 Tspo-201ENSMUST00000047419 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
Smarca4Q3TKT4 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
Smarca4Q3TKT4 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.4 ms