Protein–RNA interactions for Protein: Q3TIX9

Usp39, U4/U6.U5 tri-snRNP-associated protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 564 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp39Q3TIX9 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Usp39Q3TIX9 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Usp39Q3TIX9 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Usp39Q3TIX9 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Usp39Q3TIX9 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Usp39Q3TIX9 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Usp39Q3TIX9 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Usp39Q3TIX9 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Usp39Q3TIX9 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Usp39Q3TIX9 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Usp39Q3TIX9 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Usp39Q3TIX9 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Usp39Q3TIX9 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Usp39Q3TIX9 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Usp39Q3TIX9 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Usp39Q3TIX9 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Usp39Q3TIX9 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Usp39Q3TIX9 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Usp39Q3TIX9 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Usp39Q3TIX9 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Usp39Q3TIX9 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Usp39Q3TIX9 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Usp39Q3TIX9 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Usp39Q3TIX9 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Usp39Q3TIX9 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Usp39Q3TIX9 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Usp39Q3TIX9 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Usp39Q3TIX9 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Usp39Q3TIX9 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Usp39Q3TIX9 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Usp39Q3TIX9 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Usp39Q3TIX9 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Usp39Q3TIX9 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Usp39Q3TIX9 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Usp39Q3TIX9 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Usp39Q3TIX9 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.18
Usp39Q3TIX9 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Usp39Q3TIX9 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Usp39Q3TIX9 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Usp39Q3TIX9 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Usp39Q3TIX9 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Usp39Q3TIX9 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Usp39Q3TIX9 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Usp39Q3TIX9 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Usp39Q3TIX9 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Usp39Q3TIX9 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Usp39Q3TIX9 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Usp39Q3TIX9 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Usp39Q3TIX9 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Usp39Q3TIX9 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Usp39Q3TIX9 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Usp39Q3TIX9 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Usp39Q3TIX9 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Usp39Q3TIX9 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Usp39Q3TIX9 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Usp39Q3TIX9 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Usp39Q3TIX9 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Usp39Q3TIX9 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Usp39Q3TIX9 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Usp39Q3TIX9 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Usp39Q3TIX9 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Usp39Q3TIX9 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Usp39Q3TIX9 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Usp39Q3TIX9 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Usp39Q3TIX9 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Usp39Q3TIX9 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Usp39Q3TIX9 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Usp39Q3TIX9 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Usp39Q3TIX9 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Usp39Q3TIX9 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Usp39Q3TIX9 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Usp39Q3TIX9 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Usp39Q3TIX9 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Usp39Q3TIX9 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Usp39Q3TIX9 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Usp39Q3TIX9 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Usp39Q3TIX9 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Usp39Q3TIX9 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Usp39Q3TIX9 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Usp39Q3TIX9 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Usp39Q3TIX9 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Usp39Q3TIX9 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Usp39Q3TIX9 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Usp39Q3TIX9 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Usp39Q3TIX9 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Usp39Q3TIX9 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Usp39Q3TIX9 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Usp39Q3TIX9 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Usp39Q3TIX9 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Usp39Q3TIX9 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Usp39Q3TIX9 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Usp39Q3TIX9 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Usp39Q3TIX9 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Usp39Q3TIX9 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Usp39Q3TIX9 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Usp39Q3TIX9 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Usp39Q3TIX9 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Usp39Q3TIX9 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Usp39Q3TIX9 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Usp39Q3TIX9 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.3 ms