Protein–RNA interactions for Protein: Q3TD16

Rubcnl, Protein RUBCNL-like, mousemouse

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Length 648 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RubcnlQ3TD16 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
RubcnlQ3TD16 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
RubcnlQ3TD16 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
RubcnlQ3TD16 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
RubcnlQ3TD16 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
RubcnlQ3TD16 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
RubcnlQ3TD16 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
RubcnlQ3TD16 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
RubcnlQ3TD16 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
RubcnlQ3TD16 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
RubcnlQ3TD16 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC19.51■□□□□ 0.71
RubcnlQ3TD16 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
RubcnlQ3TD16 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC19.51■□□□□ 0.71
RubcnlQ3TD16 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
RubcnlQ3TD16 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
RubcnlQ3TD16 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
RubcnlQ3TD16 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
RubcnlQ3TD16 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
RubcnlQ3TD16 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
RubcnlQ3TD16 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
RubcnlQ3TD16 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
RubcnlQ3TD16 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
RubcnlQ3TD16 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
RubcnlQ3TD16 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
RubcnlQ3TD16 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
RubcnlQ3TD16 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
RubcnlQ3TD16 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
RubcnlQ3TD16 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
RubcnlQ3TD16 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
RubcnlQ3TD16 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
RubcnlQ3TD16 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
RubcnlQ3TD16 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
RubcnlQ3TD16 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
RubcnlQ3TD16 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
RubcnlQ3TD16 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
RubcnlQ3TD16 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
RubcnlQ3TD16 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
RubcnlQ3TD16 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC19.5■□□□□ 0.71
RubcnlQ3TD16 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
RubcnlQ3TD16 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
RubcnlQ3TD16 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
RubcnlQ3TD16 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
RubcnlQ3TD16 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
RubcnlQ3TD16 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
RubcnlQ3TD16 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
RubcnlQ3TD16 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
RubcnlQ3TD16 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
RubcnlQ3TD16 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
RubcnlQ3TD16 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
RubcnlQ3TD16 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
RubcnlQ3TD16 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
RubcnlQ3TD16 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
RubcnlQ3TD16 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
RubcnlQ3TD16 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
RubcnlQ3TD16 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
RubcnlQ3TD16 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC19.49■□□□□ 0.71
RubcnlQ3TD16 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
RubcnlQ3TD16 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
RubcnlQ3TD16 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
RubcnlQ3TD16 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
RubcnlQ3TD16 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
RubcnlQ3TD16 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
RubcnlQ3TD16 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
RubcnlQ3TD16 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
RubcnlQ3TD16 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
RubcnlQ3TD16 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
RubcnlQ3TD16 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
RubcnlQ3TD16 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
RubcnlQ3TD16 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
RubcnlQ3TD16 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
RubcnlQ3TD16 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
RubcnlQ3TD16 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
RubcnlQ3TD16 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
RubcnlQ3TD16 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
RubcnlQ3TD16 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
RubcnlQ3TD16 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
RubcnlQ3TD16 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
RubcnlQ3TD16 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
RubcnlQ3TD16 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
RubcnlQ3TD16 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
RubcnlQ3TD16 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
RubcnlQ3TD16 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
RubcnlQ3TD16 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
RubcnlQ3TD16 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
RubcnlQ3TD16 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
RubcnlQ3TD16 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
RubcnlQ3TD16 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
RubcnlQ3TD16 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
RubcnlQ3TD16 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
RubcnlQ3TD16 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
RubcnlQ3TD16 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
RubcnlQ3TD16 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
RubcnlQ3TD16 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
RubcnlQ3TD16 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC19.47■□□□□ 0.71
RubcnlQ3TD16 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
RubcnlQ3TD16 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
RubcnlQ3TD16 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
RubcnlQ3TD16 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
RubcnlQ3TD16 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
RubcnlQ3TD16 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.6 ms