Protein–RNA interactions for Protein: Q3TBN1

Tmem248, Transmembrane protein 248, mousemouse

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Length 314 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem248Q3TBN1 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tmem248Q3TBN1 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tmem248Q3TBN1 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tmem248Q3TBN1 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tmem248Q3TBN1 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tmem248Q3TBN1 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tmem248Q3TBN1 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tmem248Q3TBN1 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tmem248Q3TBN1 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tmem248Q3TBN1 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tmem248Q3TBN1 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tmem248Q3TBN1 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tmem248Q3TBN1 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tmem248Q3TBN1 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Tmem248Q3TBN1 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tmem248Q3TBN1 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tmem248Q3TBN1 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tmem248Q3TBN1 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tmem248Q3TBN1 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Tmem248Q3TBN1 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tmem248Q3TBN1 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tmem248Q3TBN1 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tmem248Q3TBN1 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tmem248Q3TBN1 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tmem248Q3TBN1 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tmem248Q3TBN1 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tmem248Q3TBN1 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tmem248Q3TBN1 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tmem248Q3TBN1 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tmem248Q3TBN1 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tmem248Q3TBN1 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tmem248Q3TBN1 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tmem248Q3TBN1 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tmem248Q3TBN1 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tmem248Q3TBN1 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tmem248Q3TBN1 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tmem248Q3TBN1 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tmem248Q3TBN1 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tmem248Q3TBN1 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Tmem248Q3TBN1 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tmem248Q3TBN1 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Tmem248Q3TBN1 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Tmem248Q3TBN1 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tmem248Q3TBN1 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tmem248Q3TBN1 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tmem248Q3TBN1 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tmem248Q3TBN1 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tmem248Q3TBN1 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tmem248Q3TBN1 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tmem248Q3TBN1 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tmem248Q3TBN1 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Tmem248Q3TBN1 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tmem248Q3TBN1 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tmem248Q3TBN1 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tmem248Q3TBN1 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tmem248Q3TBN1 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tmem248Q3TBN1 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tmem248Q3TBN1 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tmem248Q3TBN1 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tmem248Q3TBN1 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tmem248Q3TBN1 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tmem248Q3TBN1 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tmem248Q3TBN1 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tmem248Q3TBN1 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tmem248Q3TBN1 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tmem248Q3TBN1 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tmem248Q3TBN1 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tmem248Q3TBN1 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tmem248Q3TBN1 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tmem248Q3TBN1 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tmem248Q3TBN1 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tmem248Q3TBN1 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tmem248Q3TBN1 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tmem248Q3TBN1 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tmem248Q3TBN1 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tmem248Q3TBN1 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tmem248Q3TBN1 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tmem248Q3TBN1 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tmem248Q3TBN1 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tmem248Q3TBN1 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tmem248Q3TBN1 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tmem248Q3TBN1 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tmem248Q3TBN1 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tmem248Q3TBN1 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tmem248Q3TBN1 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tmem248Q3TBN1 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tmem248Q3TBN1 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tmem248Q3TBN1 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tmem248Q3TBN1 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tmem248Q3TBN1 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tmem248Q3TBN1 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tmem248Q3TBN1 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tmem248Q3TBN1 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tmem248Q3TBN1 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tmem248Q3TBN1 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Tmem248Q3TBN1 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tmem248Q3TBN1 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Tmem248Q3TBN1 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tmem248Q3TBN1 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tmem248Q3TBN1 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.7 ms