Protein–RNA interactions for Protein: Q3SYJ2

Prr27, 4930432K09Rik protein, mousemouse

Predictions only

Length 352 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prr27Q3SYJ2 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Prr27Q3SYJ2 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Prr27Q3SYJ2 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Prr27Q3SYJ2 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Prr27Q3SYJ2 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Prr27Q3SYJ2 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Prr27Q3SYJ2 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Prr27Q3SYJ2 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Prr27Q3SYJ2 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Prr27Q3SYJ2 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Prr27Q3SYJ2 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Prr27Q3SYJ2 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Prr27Q3SYJ2 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Prr27Q3SYJ2 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Prr27Q3SYJ2 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Prr27Q3SYJ2 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Prr27Q3SYJ2 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Prr27Q3SYJ2 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Prr27Q3SYJ2 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Prr27Q3SYJ2 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Prr27Q3SYJ2 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Prr27Q3SYJ2 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Prr27Q3SYJ2 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Prr27Q3SYJ2 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Prr27Q3SYJ2 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Prr27Q3SYJ2 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Prr27Q3SYJ2 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Prr27Q3SYJ2 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Prr27Q3SYJ2 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Prr27Q3SYJ2 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Prr27Q3SYJ2 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Prr27Q3SYJ2 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Prr27Q3SYJ2 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Prr27Q3SYJ2 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Prr27Q3SYJ2 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Prr27Q3SYJ2 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Prr27Q3SYJ2 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Prr27Q3SYJ2 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Prr27Q3SYJ2 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Prr27Q3SYJ2 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Prr27Q3SYJ2 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Prr27Q3SYJ2 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Prr27Q3SYJ2 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Prr27Q3SYJ2 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Prr27Q3SYJ2 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Prr27Q3SYJ2 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Prr27Q3SYJ2 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Prr27Q3SYJ2 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Prr27Q3SYJ2 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Prr27Q3SYJ2 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Prr27Q3SYJ2 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Prr27Q3SYJ2 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Prr27Q3SYJ2 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.07
Prr27Q3SYJ2 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Prr27Q3SYJ2 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Prr27Q3SYJ2 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Prr27Q3SYJ2 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Prr27Q3SYJ2 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Prr27Q3SYJ2 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Prr27Q3SYJ2 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Prr27Q3SYJ2 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Prr27Q3SYJ2 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Prr27Q3SYJ2 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Prr27Q3SYJ2 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Prr27Q3SYJ2 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Prr27Q3SYJ2 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Prr27Q3SYJ2 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Prr27Q3SYJ2 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Prr27Q3SYJ2 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Prr27Q3SYJ2 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Prr27Q3SYJ2 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Prr27Q3SYJ2 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Prr27Q3SYJ2 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Prr27Q3SYJ2 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Prr27Q3SYJ2 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Prr27Q3SYJ2 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Prr27Q3SYJ2 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Prr27Q3SYJ2 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Prr27Q3SYJ2 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Prr27Q3SYJ2 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Prr27Q3SYJ2 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Prr27Q3SYJ2 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Prr27Q3SYJ2 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Prr27Q3SYJ2 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Prr27Q3SYJ2 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Prr27Q3SYJ2 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Prr27Q3SYJ2 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Prr27Q3SYJ2 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Prr27Q3SYJ2 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Prr27Q3SYJ2 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Prr27Q3SYJ2 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Prr27Q3SYJ2 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Prr27Q3SYJ2 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Prr27Q3SYJ2 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Prr27Q3SYJ2 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Prr27Q3SYJ2 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Prr27Q3SYJ2 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Prr27Q3SYJ2 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Prr27Q3SYJ2 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Prr27Q3SYJ2 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.8 ms