Protein–RNA interactions for Protein: Q3MI99

Ccbe1, Collagen and calcium-binding EGF domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 408 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccbe1Q3MI99 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccbe1Q3MI99 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccbe1Q3MI99 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccbe1Q3MI99 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccbe1Q3MI99 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccbe1Q3MI99 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccbe1Q3MI99 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccbe1Q3MI99 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccbe1Q3MI99 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccbe1Q3MI99 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccbe1Q3MI99 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccbe1Q3MI99 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccbe1Q3MI99 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccbe1Q3MI99 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccbe1Q3MI99 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccbe1Q3MI99 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccbe1Q3MI99 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccbe1Q3MI99 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccbe1Q3MI99 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccbe1Q3MI99 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccbe1Q3MI99 Endou-202ENSMUST00000100249 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccbe1Q3MI99 Endou-201ENSMUST00000023105 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccbe1Q3MI99 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccbe1Q3MI99 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccbe1Q3MI99 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccbe1Q3MI99 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccbe1Q3MI99 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccbe1Q3MI99 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccbe1Q3MI99 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccbe1Q3MI99 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccbe1Q3MI99 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccbe1Q3MI99 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccbe1Q3MI99 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccbe1Q3MI99 Nfkb1-206ENSMUST00000164430 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccbe1Q3MI99 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccbe1Q3MI99 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccbe1Q3MI99 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccbe1Q3MI99 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccbe1Q3MI99 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccbe1Q3MI99 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccbe1Q3MI99 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccbe1Q3MI99 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccbe1Q3MI99 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccbe1Q3MI99 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccbe1Q3MI99 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccbe1Q3MI99 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccbe1Q3MI99 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccbe1Q3MI99 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccbe1Q3MI99 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccbe1Q3MI99 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccbe1Q3MI99 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccbe1Q3MI99 Oxa1l-201ENSMUST00000000985 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccbe1Q3MI99 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccbe1Q3MI99 Camk2d-204ENSMUST00000106400 2722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccbe1Q3MI99 Tle3-205ENSMUST00000159630 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccbe1Q3MI99 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccbe1Q3MI99 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccbe1Q3MI99 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccbe1Q3MI99 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccbe1Q3MI99 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccbe1Q3MI99 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccbe1Q3MI99 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccbe1Q3MI99 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccbe1Q3MI99 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccbe1Q3MI99 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccbe1Q3MI99 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccbe1Q3MI99 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccbe1Q3MI99 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccbe1Q3MI99 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccbe1Q3MI99 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccbe1Q3MI99 Tada3-201ENSMUST00000032410 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccbe1Q3MI99 Zfp212-201ENSMUST00000009411 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccbe1Q3MI99 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccbe1Q3MI99 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccbe1Q3MI99 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccbe1Q3MI99 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccbe1Q3MI99 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccbe1Q3MI99 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccbe1Q3MI99 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccbe1Q3MI99 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccbe1Q3MI99 Lsm12-202ENSMUST00000107156 2015 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccbe1Q3MI99 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccbe1Q3MI99 Rnd1-201ENSMUST00000003451 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccbe1Q3MI99 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccbe1Q3MI99 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccbe1Q3MI99 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccbe1Q3MI99 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccbe1Q3MI99 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccbe1Q3MI99 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccbe1Q3MI99 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccbe1Q3MI99 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccbe1Q3MI99 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccbe1Q3MI99 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccbe1Q3MI99 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccbe1Q3MI99 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccbe1Q3MI99 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccbe1Q3MI99 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccbe1Q3MI99 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccbe1Q3MI99 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccbe1Q3MI99 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.1 ms