Protein–RNA interactions for Protein: Q3KNL4

UPF0728 protein C10orf53 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 93 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q3KNL4 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Q3KNL4 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Q3KNL4 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Q3KNL4 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Q3KNL4 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Q3KNL4 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Q3KNL4 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Q3KNL4 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Q3KNL4 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Q3KNL4 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Q3KNL4 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Q3KNL4 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Q3KNL4 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Q3KNL4 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Q3KNL4 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Q3KNL4 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Q3KNL4 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Q3KNL4 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Q3KNL4 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Q3KNL4 Adcy1-201ENSMUST00000020706 12259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Q3KNL4 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Q3KNL4 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Q3KNL4 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Q3KNL4 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Q3KNL4 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Q3KNL4 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Q3KNL4 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Q3KNL4 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Q3KNL4 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Q3KNL4 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Q3KNL4 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Q3KNL4 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Q3KNL4 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Q3KNL4 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Q3KNL4 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Q3KNL4 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Q3KNL4 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Q3KNL4 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Q3KNL4 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Q3KNL4 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Q3KNL4 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Q3KNL4 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Q3KNL4 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Q3KNL4 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Q3KNL4 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Q3KNL4 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Q3KNL4 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Q3KNL4 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Q3KNL4 Ralgapa2-211ENSMUST00000228797 8245 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Q3KNL4 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Q3KNL4 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Q3KNL4 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Q3KNL4 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Q3KNL4 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Q3KNL4 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Q3KNL4 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Q3KNL4 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Q3KNL4 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Q3KNL4 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Q3KNL4 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Q3KNL4 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Q3KNL4 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Q3KNL4 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Q3KNL4 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Q3KNL4 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Q3KNL4 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Q3KNL4 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Q3KNL4 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Q3KNL4 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Q3KNL4 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Q3KNL4 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Q3KNL4 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Q3KNL4 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Q3KNL4 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Q3KNL4 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Q3KNL4 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Q3KNL4 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Q3KNL4 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Q3KNL4 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Q3KNL4 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Q3KNL4 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Q3KNL4 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Q3KNL4 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Q3KNL4 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Q3KNL4 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Q3KNL4 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Q3KNL4 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Q3KNL4 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Q3KNL4 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Q3KNL4 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Q3KNL4 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Q3KNL4 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Q3KNL4 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Q3KNL4 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Q3KNL4 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Q3KNL4 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Q3KNL4 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Q3KNL4 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Q3KNL4 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Q3KNL4 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.1 ms