Protein–RNA interactions for Protein: Q307W7

Kncn, Kinocilin, mousemouse

Predictions only

Length 124 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KncnQ307W7 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
KncnQ307W7 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
KncnQ307W7 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
KncnQ307W7 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
KncnQ307W7 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
KncnQ307W7 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
KncnQ307W7 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
KncnQ307W7 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
KncnQ307W7 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
KncnQ307W7 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
KncnQ307W7 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
KncnQ307W7 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
KncnQ307W7 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
KncnQ307W7 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC13.56□□□□□ -0.24
KncnQ307W7 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
KncnQ307W7 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
KncnQ307W7 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
KncnQ307W7 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
KncnQ307W7 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
KncnQ307W7 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
KncnQ307W7 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
KncnQ307W7 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
KncnQ307W7 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
KncnQ307W7 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
KncnQ307W7 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
KncnQ307W7 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
KncnQ307W7 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
KncnQ307W7 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
KncnQ307W7 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
KncnQ307W7 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
KncnQ307W7 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
KncnQ307W7 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
KncnQ307W7 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
KncnQ307W7 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
KncnQ307W7 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
KncnQ307W7 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
KncnQ307W7 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
KncnQ307W7 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
KncnQ307W7 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
KncnQ307W7 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
KncnQ307W7 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
KncnQ307W7 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
KncnQ307W7 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
KncnQ307W7 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
KncnQ307W7 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
KncnQ307W7 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
KncnQ307W7 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
KncnQ307W7 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
KncnQ307W7 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
KncnQ307W7 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
KncnQ307W7 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
KncnQ307W7 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
KncnQ307W7 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
KncnQ307W7 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
KncnQ307W7 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
KncnQ307W7 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
KncnQ307W7 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
KncnQ307W7 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
KncnQ307W7 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
KncnQ307W7 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
KncnQ307W7 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
KncnQ307W7 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
KncnQ307W7 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
KncnQ307W7 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
KncnQ307W7 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
KncnQ307W7 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
KncnQ307W7 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
KncnQ307W7 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
KncnQ307W7 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
KncnQ307W7 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
KncnQ307W7 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
KncnQ307W7 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
KncnQ307W7 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
KncnQ307W7 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
KncnQ307W7 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
KncnQ307W7 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
KncnQ307W7 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
KncnQ307W7 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
KncnQ307W7 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
KncnQ307W7 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
KncnQ307W7 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
KncnQ307W7 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
KncnQ307W7 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
KncnQ307W7 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
KncnQ307W7 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
KncnQ307W7 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
KncnQ307W7 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
KncnQ307W7 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
KncnQ307W7 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
KncnQ307W7 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC13.53□□□□□ -0.24
KncnQ307W7 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
KncnQ307W7 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
KncnQ307W7 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
KncnQ307W7 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
KncnQ307W7 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
KncnQ307W7 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
KncnQ307W7 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
KncnQ307W7 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
KncnQ307W7 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
KncnQ307W7 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.7 ms