Protein–RNA interactions for Protein: Q2UY11

Col28a1, Collagen alpha-1(XXVIII) chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,141 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col28a1Q2UY11 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Col28a1Q2UY11 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Col28a1Q2UY11 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Col28a1Q2UY11 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Col28a1Q2UY11 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Col28a1Q2UY11 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Col28a1Q2UY11 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Col28a1Q2UY11 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Col28a1Q2UY11 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Col28a1Q2UY11 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Col28a1Q2UY11 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Col28a1Q2UY11 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Col28a1Q2UY11 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Col28a1Q2UY11 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Col28a1Q2UY11 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Col28a1Q2UY11 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Col28a1Q2UY11 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Col28a1Q2UY11 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Col28a1Q2UY11 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Col28a1Q2UY11 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Col28a1Q2UY11 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Col28a1Q2UY11 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Col28a1Q2UY11 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Col28a1Q2UY11 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Col28a1Q2UY11 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Col28a1Q2UY11 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Col28a1Q2UY11 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Col28a1Q2UY11 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Col28a1Q2UY11 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Col28a1Q2UY11 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Col28a1Q2UY11 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Col28a1Q2UY11 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Col28a1Q2UY11 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Col28a1Q2UY11 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Col28a1Q2UY11 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Col28a1Q2UY11 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Col28a1Q2UY11 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Col28a1Q2UY11 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Col28a1Q2UY11 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Col28a1Q2UY11 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Col28a1Q2UY11 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Col28a1Q2UY11 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Col28a1Q2UY11 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Col28a1Q2UY11 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Col28a1Q2UY11 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Col28a1Q2UY11 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Col28a1Q2UY11 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Col28a1Q2UY11 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Col28a1Q2UY11 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Col28a1Q2UY11 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Col28a1Q2UY11 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Col28a1Q2UY11 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Col28a1Q2UY11 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Col28a1Q2UY11 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Col28a1Q2UY11 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Col28a1Q2UY11 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Col28a1Q2UY11 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Col28a1Q2UY11 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Col28a1Q2UY11 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Col28a1Q2UY11 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Col28a1Q2UY11 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Col28a1Q2UY11 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Col28a1Q2UY11 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Col28a1Q2UY11 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Col28a1Q2UY11 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Col28a1Q2UY11 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Col28a1Q2UY11 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Col28a1Q2UY11 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Col28a1Q2UY11 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Col28a1Q2UY11 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Col28a1Q2UY11 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Col28a1Q2UY11 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Col28a1Q2UY11 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Col28a1Q2UY11 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Col28a1Q2UY11 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Col28a1Q2UY11 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Col28a1Q2UY11 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Col28a1Q2UY11 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Col28a1Q2UY11 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Col28a1Q2UY11 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Col28a1Q2UY11 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Col28a1Q2UY11 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Col28a1Q2UY11 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Col28a1Q2UY11 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Col28a1Q2UY11 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Col28a1Q2UY11 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Col28a1Q2UY11 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Col28a1Q2UY11 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Col28a1Q2UY11 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Col28a1Q2UY11 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Col28a1Q2UY11 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Col28a1Q2UY11 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Col28a1Q2UY11 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Col28a1Q2UY11 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Col28a1Q2UY11 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Col28a1Q2UY11 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Col28a1Q2UY11 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Col28a1Q2UY11 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Col28a1Q2UY11 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Col28a1Q2UY11 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.8 ms