Protein–RNA interactions for Protein: Q2TV84

Trpm1, Transient receptor potential cation channel subfamily M member 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,622 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trpm1Q2TV84 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Trpm1Q2TV84 Gm36972-201ENSMUST00000194000 676 ntTSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Trpm1Q2TV84 1110035H17Rik-202ENSMUST00000205672 1231 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
Trpm1Q2TV84 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Trpm1Q2TV84 Ndufv2-201ENSMUST00000024909 927 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Trpm1Q2TV84 Prdx4-201ENSMUST00000026328 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Trpm1Q2TV84 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.39
Trpm1Q2TV84 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Trpm1Q2TV84 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Trpm1Q2TV84 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Trpm1Q2TV84 Ndufa1-201ENSMUST00000016571 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Trpm1Q2TV84 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Trpm1Q2TV84 Gm5253-201ENSMUST00000187104 1025 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
Trpm1Q2TV84 Msantd1-204ENSMUST00000212362 798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Trpm1Q2TV84 Elof1-203ENSMUST00000213233 810 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Trpm1Q2TV84 Gm15500-202ENSMUST00000071641 1019 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
Trpm1Q2TV84 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Trpm1Q2TV84 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Trpm1Q2TV84 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Trpm1Q2TV84 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Trpm1Q2TV84 4933434E20Rik-203ENSMUST00000068798 1500 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Trpm1Q2TV84 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Trpm1Q2TV84 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Trpm1Q2TV84 Gm38708-201ENSMUST00000203855 677 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Trpm1Q2TV84 Tspan18-201ENSMUST00000028646 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Trpm1Q2TV84 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Trpm1Q2TV84 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Trpm1Q2TV84 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Trpm1Q2TV84 Znrf1-213ENSMUST00000174333 515 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Trpm1Q2TV84 2310001H17Rik-206ENSMUST00000205051 676 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Trpm1Q2TV84 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Trpm1Q2TV84 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Trpm1Q2TV84 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Trpm1Q2TV84 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Trpm1Q2TV84 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Trpm1Q2TV84 Rhox7b-201ENSMUST00000115156 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Trpm1Q2TV84 Gm16156-201ENSMUST00000141168 713 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Trpm1Q2TV84 Nudt6-208ENSMUST00000146324 1264 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Trpm1Q2TV84 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Trpm1Q2TV84 Pts-201ENSMUST00000034570 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Trpm1Q2TV84 Spr-201ENSMUST00000045986 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Trpm1Q2TV84 Meaf6-201ENSMUST00000055213 872 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Trpm1Q2TV84 Rhox7a-201ENSMUST00000096454 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Trpm1Q2TV84 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Trpm1Q2TV84 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Trpm1Q2TV84 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Trpm1Q2TV84 Gm4913-201ENSMUST00000117075 1290 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
Trpm1Q2TV84 Retsat-204ENSMUST00000176168 1203 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Trpm1Q2TV84 Gm45231-201ENSMUST00000208629 1064 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Trpm1Q2TV84 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Trpm1Q2TV84 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Trpm1Q2TV84 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Trpm1Q2TV84 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Trpm1Q2TV84 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Trpm1Q2TV84 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Trpm1Q2TV84 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Trpm1Q2TV84 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Trpm1Q2TV84 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Trpm1Q2TV84 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Trpm1Q2TV84 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Trpm1Q2TV84 Hsf4-203ENSMUST00000172525 1276 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Trpm1Q2TV84 4930593A02Rik-202ENSMUST00000203879 938 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Trpm1Q2TV84 AC174742.1-201ENSMUST00000218272 304 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
Trpm1Q2TV84 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Trpm1Q2TV84 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Trpm1Q2TV84 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Trpm1Q2TV84 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Trpm1Q2TV84 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Trpm1Q2TV84 Arid2-202ENSMUST00000134985 809 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Trpm1Q2TV84 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
Trpm1Q2TV84 Ndufv3-202ENSMUST00000064798 485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Trpm1Q2TV84 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Trpm1Q2TV84 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Trpm1Q2TV84 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Trpm1Q2TV84 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Trpm1Q2TV84 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Trpm1Q2TV84 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Trpm1Q2TV84 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Trpm1Q2TV84 Tmub1-201ENSMUST00000030799 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Trpm1Q2TV84 Larp1b-205ENSMUST00000191805 1581 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.39
Trpm1Q2TV84 Gm10044-203ENSMUST00000166813 1471 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
Trpm1Q2TV84 Timm9-205ENSMUST00000221178 529 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.39
Trpm1Q2TV84 AC158982.1-201ENSMUST00000228377 901 ntBASIC23.7■■□□□ 1.39
Trpm1Q2TV84 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Trpm1Q2TV84 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Trpm1Q2TV84 Sfn-201ENSMUST00000057311 1613 ntAPPRIS P1 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Trpm1Q2TV84 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Trpm1Q2TV84 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Trpm1Q2TV84 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Trpm1Q2TV84 Meig1-204ENSMUST00000115083 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Trpm1Q2TV84 Rabep1-208ENSMUST00000179114 1264 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Trpm1Q2TV84 Erp27-201ENSMUST00000032343 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Trpm1Q2TV84 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Trpm1Q2TV84 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Trpm1Q2TV84 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Trpm1Q2TV84 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Trpm1Q2TV84 1700029J07Rik-202ENSMUST00000098786 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Trpm1Q2TV84 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Trpm1Q2TV84 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Trpm1Q2TV84 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.4 ms