Protein–RNA interactions for Protein: Q2LKU9

Nlrp1a, NACHT, LRR and PYD domains-containing protein 1a, mousemouse

Predictions only

Length 1,182 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nlrp1aQ2LKU9 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Nlrp1aQ2LKU9 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Nlrp1aQ2LKU9 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Nlrp1aQ2LKU9 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Nlrp1aQ2LKU9 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Nlrp1aQ2LKU9 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Nlrp1aQ2LKU9 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Nlrp1aQ2LKU9 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Nlrp1aQ2LKU9 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Nlrp1aQ2LKU9 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Nlrp1aQ2LKU9 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Nlrp1aQ2LKU9 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Nlrp1aQ2LKU9 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Nlrp1aQ2LKU9 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Nlrp1aQ2LKU9 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Nlrp1aQ2LKU9 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Nlrp1aQ2LKU9 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Nlrp1aQ2LKU9 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Nlrp1aQ2LKU9 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Nlrp1aQ2LKU9 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Nlrp1aQ2LKU9 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Nlrp1aQ2LKU9 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Nlrp1aQ2LKU9 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Nlrp1aQ2LKU9 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Nlrp1aQ2LKU9 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Nlrp1aQ2LKU9 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Nlrp1aQ2LKU9 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Nlrp1aQ2LKU9 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Nlrp1aQ2LKU9 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Nlrp1aQ2LKU9 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Nlrp1aQ2LKU9 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Nlrp1aQ2LKU9 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Nlrp1aQ2LKU9 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Nlrp1aQ2LKU9 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Nlrp1aQ2LKU9 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Nlrp1aQ2LKU9 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Nlrp1aQ2LKU9 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Nlrp1aQ2LKU9 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Nlrp1aQ2LKU9 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Nlrp1aQ2LKU9 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Nlrp1aQ2LKU9 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Nlrp1aQ2LKU9 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Nlrp1aQ2LKU9 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Nlrp1aQ2LKU9 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Nlrp1aQ2LKU9 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Nlrp1aQ2LKU9 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Nlrp1aQ2LKU9 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Nlrp1aQ2LKU9 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Nlrp1aQ2LKU9 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Nlrp1aQ2LKU9 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Nlrp1aQ2LKU9 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Nlrp1aQ2LKU9 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Nlrp1aQ2LKU9 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Nlrp1aQ2LKU9 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Nlrp1aQ2LKU9 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Nlrp1aQ2LKU9 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Nlrp1aQ2LKU9 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Nlrp1aQ2LKU9 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Nlrp1aQ2LKU9 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Nlrp1aQ2LKU9 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Nlrp1aQ2LKU9 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Nlrp1aQ2LKU9 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Nlrp1aQ2LKU9 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Nlrp1aQ2LKU9 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Nlrp1aQ2LKU9 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Nlrp1aQ2LKU9 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Nlrp1aQ2LKU9 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Nlrp1aQ2LKU9 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Nlrp1aQ2LKU9 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Nlrp1aQ2LKU9 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC20.08■□□□□ 0.8
Nlrp1aQ2LKU9 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Nlrp1aQ2LKU9 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Nlrp1aQ2LKU9 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Nlrp1aQ2LKU9 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Nlrp1aQ2LKU9 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Nlrp1aQ2LKU9 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Nlrp1aQ2LKU9 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Nlrp1aQ2LKU9 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Nlrp1aQ2LKU9 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Nlrp1aQ2LKU9 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Nlrp1aQ2LKU9 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Nlrp1aQ2LKU9 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Nlrp1aQ2LKU9 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Nlrp1aQ2LKU9 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Nlrp1aQ2LKU9 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Nlrp1aQ2LKU9 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Nlrp1aQ2LKU9 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Nlrp1aQ2LKU9 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Nlrp1aQ2LKU9 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Nlrp1aQ2LKU9 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Nlrp1aQ2LKU9 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Nlrp1aQ2LKU9 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Nlrp1aQ2LKU9 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Nlrp1aQ2LKU9 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Nlrp1aQ2LKU9 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Nlrp1aQ2LKU9 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Nlrp1aQ2LKU9 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Nlrp1aQ2LKU9 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Nlrp1aQ2LKU9 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Nlrp1aQ2LKU9 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.6 ms