Protein–RNA interactions for Protein: Q14BE7

Fam47c, Family with sequence similarity 47, member A, mousemouse

Predictions only

Length 430 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam47cQ14BE7 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Fam47cQ14BE7 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Fam47cQ14BE7 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Fam47cQ14BE7 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Fam47cQ14BE7 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Fam47cQ14BE7 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Fam47cQ14BE7 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Fam47cQ14BE7 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Fam47cQ14BE7 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Fam47cQ14BE7 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Fam47cQ14BE7 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Fam47cQ14BE7 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Fam47cQ14BE7 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Fam47cQ14BE7 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Fam47cQ14BE7 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Fam47cQ14BE7 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Fam47cQ14BE7 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Fam47cQ14BE7 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Fam47cQ14BE7 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Fam47cQ14BE7 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Fam47cQ14BE7 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Fam47cQ14BE7 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Fam47cQ14BE7 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Fam47cQ14BE7 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Fam47cQ14BE7 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Fam47cQ14BE7 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Fam47cQ14BE7 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Fam47cQ14BE7 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Fam47cQ14BE7 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Fam47cQ14BE7 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Fam47cQ14BE7 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Fam47cQ14BE7 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Fam47cQ14BE7 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Fam47cQ14BE7 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Fam47cQ14BE7 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Fam47cQ14BE7 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Fam47cQ14BE7 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Fam47cQ14BE7 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
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Fam47cQ14BE7 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Fam47cQ14BE7 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Fam47cQ14BE7 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Fam47cQ14BE7 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Fam47cQ14BE7 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Fam47cQ14BE7 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
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Fam47cQ14BE7 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Fam47cQ14BE7 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Fam47cQ14BE7 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Fam47cQ14BE7 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Fam47cQ14BE7 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Fam47cQ14BE7 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Fam47cQ14BE7 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Fam47cQ14BE7 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Fam47cQ14BE7 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Fam47cQ14BE7 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Fam47cQ14BE7 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Fam47cQ14BE7 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Fam47cQ14BE7 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Fam47cQ14BE7 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Fam47cQ14BE7 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
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Fam47cQ14BE7 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
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Fam47cQ14BE7 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
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Fam47cQ14BE7 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Fam47cQ14BE7 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
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Fam47cQ14BE7 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Fam47cQ14BE7 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Fam47cQ14BE7 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Fam47cQ14BE7 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Fam47cQ14BE7 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Fam47cQ14BE7 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Fam47cQ14BE7 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Fam47cQ14BE7 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Fam47cQ14BE7 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Fam47cQ14BE7 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Fam47cQ14BE7 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Fam47cQ14BE7 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Fam47cQ14BE7 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Fam47cQ14BE7 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Fam47cQ14BE7 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
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