Protein–RNA interactions for Protein: Q14AI6

Rpusd3, Mitochondrial mRNA pseudouridine synthase Rpusd3, mousemouse

Predictions only

Length 344 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpusd3Q14AI6 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rpusd3Q14AI6 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rpusd3Q14AI6 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rpusd3Q14AI6 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rpusd3Q14AI6 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rpusd3Q14AI6 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rpusd3Q14AI6 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rpusd3Q14AI6 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rpusd3Q14AI6 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rpusd3Q14AI6 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rpusd3Q14AI6 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rpusd3Q14AI6 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rpusd3Q14AI6 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rpusd3Q14AI6 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rpusd3Q14AI6 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rpusd3Q14AI6 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rpusd3Q14AI6 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rpusd3Q14AI6 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rpusd3Q14AI6 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rpusd3Q14AI6 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rpusd3Q14AI6 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rpusd3Q14AI6 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rpusd3Q14AI6 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rpusd3Q14AI6 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rpusd3Q14AI6 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rpusd3Q14AI6 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rpusd3Q14AI6 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rpusd3Q14AI6 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rpusd3Q14AI6 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rpusd3Q14AI6 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rpusd3Q14AI6 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rpusd3Q14AI6 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rpusd3Q14AI6 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rpusd3Q14AI6 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rpusd3Q14AI6 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rpusd3Q14AI6 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rpusd3Q14AI6 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rpusd3Q14AI6 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rpusd3Q14AI6 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rpusd3Q14AI6 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rpusd3Q14AI6 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rpusd3Q14AI6 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Rpusd3Q14AI6 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rpusd3Q14AI6 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rpusd3Q14AI6 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rpusd3Q14AI6 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rpusd3Q14AI6 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rpusd3Q14AI6 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rpusd3Q14AI6 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rpusd3Q14AI6 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rpusd3Q14AI6 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rpusd3Q14AI6 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rpusd3Q14AI6 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rpusd3Q14AI6 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rpusd3Q14AI6 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rpusd3Q14AI6 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rpusd3Q14AI6 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rpusd3Q14AI6 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rpusd3Q14AI6 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rpusd3Q14AI6 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rpusd3Q14AI6 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rpusd3Q14AI6 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Rpusd3Q14AI6 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rpusd3Q14AI6 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rpusd3Q14AI6 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rpusd3Q14AI6 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rpusd3Q14AI6 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rpusd3Q14AI6 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rpusd3Q14AI6 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rpusd3Q14AI6 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rpusd3Q14AI6 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rpusd3Q14AI6 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rpusd3Q14AI6 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rpusd3Q14AI6 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rpusd3Q14AI6 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rpusd3Q14AI6 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Rpusd3Q14AI6 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rpusd3Q14AI6 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rpusd3Q14AI6 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rpusd3Q14AI6 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rpusd3Q14AI6 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rpusd3Q14AI6 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rpusd3Q14AI6 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rpusd3Q14AI6 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rpusd3Q14AI6 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rpusd3Q14AI6 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Rpusd3Q14AI6 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rpusd3Q14AI6 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rpusd3Q14AI6 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rpusd3Q14AI6 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rpusd3Q14AI6 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rpusd3Q14AI6 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rpusd3Q14AI6 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rpusd3Q14AI6 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rpusd3Q14AI6 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Rpusd3Q14AI6 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Rpusd3Q14AI6 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Rpusd3Q14AI6 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Rpusd3Q14AI6 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Rpusd3Q14AI6 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.1 ms