Protein–RNA interactions for Protein: Q0VE82

Cpne7, Copine-7, mousemouse

Predictions only

Length 557 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cpne7Q0VE82 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Cpne7Q0VE82 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Cpne7Q0VE82 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Cpne7Q0VE82 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Cpne7Q0VE82 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Cpne7Q0VE82 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Cpne7Q0VE82 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Cpne7Q0VE82 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Cpne7Q0VE82 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Cpne7Q0VE82 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Cpne7Q0VE82 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Cpne7Q0VE82 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Cpne7Q0VE82 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Cpne7Q0VE82 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Cpne7Q0VE82 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Cpne7Q0VE82 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Cpne7Q0VE82 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Cpne7Q0VE82 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Cpne7Q0VE82 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Cpne7Q0VE82 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Cpne7Q0VE82 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Cpne7Q0VE82 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Cpne7Q0VE82 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Cpne7Q0VE82 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Cpne7Q0VE82 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Cpne7Q0VE82 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Cpne7Q0VE82 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Cpne7Q0VE82 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Cpne7Q0VE82 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Cpne7Q0VE82 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Cpne7Q0VE82 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Cpne7Q0VE82 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Cpne7Q0VE82 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Cpne7Q0VE82 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Cpne7Q0VE82 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Cpne7Q0VE82 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Cpne7Q0VE82 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Cpne7Q0VE82 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Cpne7Q0VE82 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Cpne7Q0VE82 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Cpne7Q0VE82 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Cpne7Q0VE82 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Cpne7Q0VE82 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.38
Cpne7Q0VE82 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Cpne7Q0VE82 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Cpne7Q0VE82 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Cpne7Q0VE82 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Cpne7Q0VE82 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Cpne7Q0VE82 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Cpne7Q0VE82 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Cpne7Q0VE82 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Cpne7Q0VE82 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Cpne7Q0VE82 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Cpne7Q0VE82 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Cpne7Q0VE82 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Cpne7Q0VE82 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Cpne7Q0VE82 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Cpne7Q0VE82 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Cpne7Q0VE82 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Cpne7Q0VE82 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cpne7Q0VE82 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cpne7Q0VE82 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cpne7Q0VE82 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cpne7Q0VE82 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cpne7Q0VE82 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cpne7Q0VE82 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Cpne7Q0VE82 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cpne7Q0VE82 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cpne7Q0VE82 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Cpne7Q0VE82 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cpne7Q0VE82 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cpne7Q0VE82 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cpne7Q0VE82 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cpne7Q0VE82 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cpne7Q0VE82 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Cpne7Q0VE82 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cpne7Q0VE82 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cpne7Q0VE82 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cpne7Q0VE82 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cpne7Q0VE82 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cpne7Q0VE82 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cpne7Q0VE82 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cpne7Q0VE82 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cpne7Q0VE82 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cpne7Q0VE82 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Cpne7Q0VE82 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cpne7Q0VE82 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cpne7Q0VE82 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cpne7Q0VE82 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cpne7Q0VE82 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cpne7Q0VE82 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cpne7Q0VE82 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cpne7Q0VE82 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cpne7Q0VE82 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cpne7Q0VE82 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cpne7Q0VE82 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Cpne7Q0VE82 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cpne7Q0VE82 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cpne7Q0VE82 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cpne7Q0VE82 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.2 ms