Protein–RNA interactions for Protein: Q0KL02

Trio, Triple functional domain protein, mousemouse

Predictions only

Length 3,102 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TrioQ0KL02 Rhox2a-202ENSMUST00000173650 735 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
TrioQ0KL02 Rhox2c-204ENSMUST00000184688 720 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
TrioQ0KL02 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
TrioQ0KL02 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
TrioQ0KL02 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
TrioQ0KL02 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
TrioQ0KL02 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
TrioQ0KL02 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
TrioQ0KL02 Vsig2-206ENSMUST00000215957 851 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
TrioQ0KL02 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
TrioQ0KL02 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
TrioQ0KL02 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
TrioQ0KL02 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
TrioQ0KL02 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
TrioQ0KL02 Igf2-203ENSMUST00000105935 650 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
TrioQ0KL02 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
TrioQ0KL02 Gm35911-201ENSMUST00000198837 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
TrioQ0KL02 5830454E08Rik-202ENSMUST00000213974 744 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
TrioQ0KL02 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
TrioQ0KL02 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
TrioQ0KL02 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
TrioQ0KL02 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
TrioQ0KL02 Gm44945-201ENSMUST00000206764 1187 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
TrioQ0KL02 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
TrioQ0KL02 Olfr30-201ENSMUST00000055204 1066 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.32
TrioQ0KL02 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
TrioQ0KL02 Dusp13-203ENSMUST00000120956 1070 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
TrioQ0KL02 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
TrioQ0KL02 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
TrioQ0KL02 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
TrioQ0KL02 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
TrioQ0KL02 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
TrioQ0KL02 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.31
TrioQ0KL02 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TrioQ0KL02 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TrioQ0KL02 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
TrioQ0KL02 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
TrioQ0KL02 Gm2109-201ENSMUST00000189326 1409 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TrioQ0KL02 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
TrioQ0KL02 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TrioQ0KL02 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TrioQ0KL02 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TrioQ0KL02 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TrioQ0KL02 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
TrioQ0KL02 Ociad1-210ENSMUST00000202250 800 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
TrioQ0KL02 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
TrioQ0KL02 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TrioQ0KL02 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TrioQ0KL02 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
TrioQ0KL02 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TrioQ0KL02 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TrioQ0KL02 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC17■□□□□ 0.31
TrioQ0KL02 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
TrioQ0KL02 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TrioQ0KL02 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TrioQ0KL02 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
TrioQ0KL02 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TrioQ0KL02 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TrioQ0KL02 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TrioQ0KL02 Ern1-202ENSMUST00000106799 660 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TrioQ0KL02 Orc6-201ENSMUST00000034132 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TrioQ0KL02 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TrioQ0KL02 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TrioQ0KL02 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TrioQ0KL02 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TrioQ0KL02 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TrioQ0KL02 Gm14268-201ENSMUST00000132465 682 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TrioQ0KL02 Ndufa1-201ENSMUST00000016571 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TrioQ0KL02 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TrioQ0KL02 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TrioQ0KL02 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TrioQ0KL02 Fam103a1-202ENSMUST00000118190 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TrioQ0KL02 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
TrioQ0KL02 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TrioQ0KL02 Gm36972-201ENSMUST00000194000 676 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TrioQ0KL02 Mcee-203ENSMUST00000206194 532 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TrioQ0KL02 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TrioQ0KL02 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TrioQ0KL02 Hmgcl-201ENSMUST00000030432 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TrioQ0KL02 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TrioQ0KL02 Znrf1-213ENSMUST00000174333 515 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TrioQ0KL02 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TrioQ0KL02 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TrioQ0KL02 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TrioQ0KL02 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TrioQ0KL02 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TrioQ0KL02 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TrioQ0KL02 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TrioQ0KL02 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TrioQ0KL02 Gm17114-201ENSMUST00000164716 511 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TrioQ0KL02 Hsf4-203ENSMUST00000172525 1276 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TrioQ0KL02 AC140375.2-201ENSMUST00000225283 584 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
TrioQ0KL02 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TrioQ0KL02 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TrioQ0KL02 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TrioQ0KL02 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TrioQ0KL02 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TrioQ0KL02 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TrioQ0KL02 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TrioQ0KL02 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.7 ms