Protein–RNA interactions for Protein: Q0KL01

Ubxn2b, UBX domain-containing protein 2B, mousemouse

Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubxn2bQ0KL01 Esrrb-206ENSMUST00000167891 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ubxn2bQ0KL01 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ubxn2bQ0KL01 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ubxn2bQ0KL01 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ubxn2bQ0KL01 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ubxn2bQ0KL01 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ubxn2bQ0KL01 Gm15653-201ENSMUST00000119247 907 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Ubxn2bQ0KL01 Dusp13-203ENSMUST00000120956 1070 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ubxn2bQ0KL01 Gm17968-201ENSMUST00000194902 784 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Ubxn2bQ0KL01 2900055J20Rik-201ENSMUST00000096572 723 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ubxn2bQ0KL01 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Ubxn2bQ0KL01 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Ubxn2bQ0KL01 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Ubxn2bQ0KL01 Gm13332-201ENSMUST00000120451 1398 ntBASIC20.08■□□□□ 0.8
Ubxn2bQ0KL01 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ubxn2bQ0KL01 Renbp-201ENSMUST00000114379 1318 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ubxn2bQ0KL01 Tmem37-201ENSMUST00000056089 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ubxn2bQ0KL01 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ubxn2bQ0KL01 Fam126b-201ENSMUST00000038372 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ubxn2bQ0KL01 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ubxn2bQ0KL01 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Ubxn2bQ0KL01 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ubxn2bQ0KL01 Cops9-202ENSMUST00000112999 653 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ubxn2bQ0KL01 Tmem9-205ENSMUST00000165125 901 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ubxn2bQ0KL01 Gm44596-201ENSMUST00000204223 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ubxn2bQ0KL01 Tex12-202ENSMUST00000217236 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ubxn2bQ0KL01 Pdzd11-202ENSMUST00000059099 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ubxn2bQ0KL01 Med8-202ENSMUST00000073881 1052 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ubxn2bQ0KL01 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ubxn2bQ0KL01 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ubxn2bQ0KL01 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ubxn2bQ0KL01 Thap6-204ENSMUST00000193925 1337 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ubxn2bQ0KL01 4933412A08Rik-201ENSMUST00000061046 1343 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Ubxn2bQ0KL01 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ubxn2bQ0KL01 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ubxn2bQ0KL01 Gm22175-201ENSMUST00000175007 78 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Ubxn2bQ0KL01 Gm27622-201ENSMUST00000183779 60 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Ubxn2bQ0KL01 Gm34866-201ENSMUST00000196146 515 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ubxn2bQ0KL01 Gm40123-201ENSMUST00000198175 1027 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ubxn2bQ0KL01 Gm45167-201ENSMUST00000208007 322 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Ubxn2bQ0KL01 Tex12-201ENSMUST00000034568 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ubxn2bQ0KL01 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ubxn2bQ0KL01 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Ubxn2bQ0KL01 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ubxn2bQ0KL01 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ubxn2bQ0KL01 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ubxn2bQ0KL01 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ubxn2bQ0KL01 Gm11515-201ENSMUST00000150818 701 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ubxn2bQ0KL01 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ubxn2bQ0KL01 Tspyl-ps-201ENSMUST00000220692 1117 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
Ubxn2bQ0KL01 Gm6566-201ENSMUST00000221468 1171 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ubxn2bQ0KL01 Hnrnpa1l2-ps2-201ENSMUST00000022493 963 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
Ubxn2bQ0KL01 Pemt-201ENSMUST00000000310 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ubxn2bQ0KL01 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ubxn2bQ0KL01 G430095P16Rik-201ENSMUST00000098571 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ubxn2bQ0KL01 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ubxn2bQ0KL01 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ubxn2bQ0KL01 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ubxn2bQ0KL01 Sftpb-204ENSMUST00000183018 1490 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ubxn2bQ0KL01 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ubxn2bQ0KL01 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
Ubxn2bQ0KL01 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ubxn2bQ0KL01 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ubxn2bQ0KL01 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ubxn2bQ0KL01 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
Ubxn2bQ0KL01 AC124732.2-201ENSMUST00000221977 316 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
Ubxn2bQ0KL01 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ubxn2bQ0KL01 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ubxn2bQ0KL01 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ubxn2bQ0KL01 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ubxn2bQ0KL01 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ubxn2bQ0KL01 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ubxn2bQ0KL01 Rogdi-201ENSMUST00000023191 1431 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ubxn2bQ0KL01 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ubxn2bQ0KL01 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ubxn2bQ0KL01 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ubxn2bQ0KL01 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ubxn2bQ0KL01 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ubxn2bQ0KL01 Aimp2-202ENSMUST00000100483 1073 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ubxn2bQ0KL01 Gm45799-202ENSMUST00000106786 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ubxn2bQ0KL01 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ubxn2bQ0KL01 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ubxn2bQ0KL01 Aimp2-201ENSMUST00000031613 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ubxn2bQ0KL01 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ubxn2bQ0KL01 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ubxn2bQ0KL01 Dcun1d3-203ENSMUST00000106519 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ubxn2bQ0KL01 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ubxn2bQ0KL01 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ubxn2bQ0KL01 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ubxn2bQ0KL01 Gm27198-201ENSMUST00000184172 1517 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ubxn2bQ0KL01 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ubxn2bQ0KL01 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ubxn2bQ0KL01 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ubxn2bQ0KL01 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ubxn2bQ0KL01 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ubxn2bQ0KL01 Gm8825-201ENSMUST00000182565 998 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
Ubxn2bQ0KL01 Ybx1-ps2-201ENSMUST00000201305 957 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
Ubxn2bQ0KL01 AC140397.2-201ENSMUST00000224213 834 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
Ubxn2bQ0KL01 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ubxn2bQ0KL01 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.8 ms