Protein–RNA interactions for Protein: Q09098

Pate4, Prostate and testis expressed protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 99 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pate4Q09098 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Pate4Q09098 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Pate4Q09098 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Pate4Q09098 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Pate4Q09098 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Pate4Q09098 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Pate4Q09098 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Pate4Q09098 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Pate4Q09098 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Pate4Q09098 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Pate4Q09098 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Pate4Q09098 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Pate4Q09098 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Pate4Q09098 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Pate4Q09098 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Pate4Q09098 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Pate4Q09098 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Pate4Q09098 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Pate4Q09098 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Pate4Q09098 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Pate4Q09098 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Pate4Q09098 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Pate4Q09098 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Pate4Q09098 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Pate4Q09098 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Pate4Q09098 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Pate4Q09098 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Pate4Q09098 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Pate4Q09098 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Pate4Q09098 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Pate4Q09098 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Pate4Q09098 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Pate4Q09098 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Pate4Q09098 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Pate4Q09098 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Pate4Q09098 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Pate4Q09098 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Pate4Q09098 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Pate4Q09098 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Pate4Q09098 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Pate4Q09098 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Pate4Q09098 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Pate4Q09098 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Pate4Q09098 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Pate4Q09098 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Pate4Q09098 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Pate4Q09098 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Pate4Q09098 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Pate4Q09098 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Pate4Q09098 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Pate4Q09098 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Pate4Q09098 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Pate4Q09098 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Pate4Q09098 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Pate4Q09098 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Pate4Q09098 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Pate4Q09098 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Pate4Q09098 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Pate4Q09098 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Pate4Q09098 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Pate4Q09098 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Pate4Q09098 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Pate4Q09098 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Pate4Q09098 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Pate4Q09098 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Pate4Q09098 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Pate4Q09098 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Pate4Q09098 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Pate4Q09098 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Pate4Q09098 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Pate4Q09098 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Pate4Q09098 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Pate4Q09098 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Pate4Q09098 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Pate4Q09098 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Pate4Q09098 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Pate4Q09098 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Pate4Q09098 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Pate4Q09098 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Pate4Q09098 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Pate4Q09098 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Pate4Q09098 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Pate4Q09098 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Pate4Q09098 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Pate4Q09098 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Pate4Q09098 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Pate4Q09098 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Pate4Q09098 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Pate4Q09098 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Pate4Q09098 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Pate4Q09098 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Pate4Q09098 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Pate4Q09098 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Pate4Q09098 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Pate4Q09098 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.23
Pate4Q09098 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Pate4Q09098 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Pate4Q09098 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Pate4Q09098 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Pate4Q09098 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.8 ms