Protein–RNA interactions for Protein: Q07968

F13b, Coagulation factor XIII B chain, mousemouse

Predictions only

Length 669 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
F13bQ07968 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
F13bQ07968 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC14.45□□□□□ -0.1
F13bQ07968 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
F13bQ07968 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
F13bQ07968 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
F13bQ07968 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
F13bQ07968 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC14.45□□□□□ -0.1
F13bQ07968 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC14.45□□□□□ -0.1
F13bQ07968 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
F13bQ07968 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
F13bQ07968 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
F13bQ07968 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
F13bQ07968 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
F13bQ07968 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
F13bQ07968 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
F13bQ07968 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
F13bQ07968 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
F13bQ07968 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.44□□□□□ -0.1
F13bQ07968 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
F13bQ07968 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
F13bQ07968 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
F13bQ07968 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
F13bQ07968 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
F13bQ07968 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
F13bQ07968 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
F13bQ07968 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC14.44□□□□□ -0.1
F13bQ07968 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
F13bQ07968 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
F13bQ07968 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
F13bQ07968 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.44□□□□□ -0.1
F13bQ07968 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
F13bQ07968 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
F13bQ07968 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
F13bQ07968 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.43□□□□□ -0.1
F13bQ07968 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC14.43□□□□□ -0.1
F13bQ07968 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.43□□□□□ -0.1
F13bQ07968 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
F13bQ07968 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC14.43□□□□□ -0.1
F13bQ07968 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
F13bQ07968 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
F13bQ07968 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC14.43□□□□□ -0.1
F13bQ07968 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
F13bQ07968 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
F13bQ07968 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC14.43□□□□□ -0.1
F13bQ07968 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
F13bQ07968 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
F13bQ07968 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
F13bQ07968 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
F13bQ07968 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
F13bQ07968 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
F13bQ07968 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.43□□□□□ -0.1
F13bQ07968 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
F13bQ07968 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
F13bQ07968 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
F13bQ07968 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.43□□□□□ -0.1
F13bQ07968 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC14.43□□□□□ -0.1
F13bQ07968 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
F13bQ07968 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
F13bQ07968 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
F13bQ07968 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
F13bQ07968 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
F13bQ07968 Uqcc2-203ENSMUST00000119227 452 ntTSL 3 BASIC14.42□□□□□ -0.1
F13bQ07968 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.42□□□□□ -0.1
F13bQ07968 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
F13bQ07968 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC14.42□□□□□ -0.1
F13bQ07968 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
F13bQ07968 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
F13bQ07968 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
F13bQ07968 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
F13bQ07968 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC14.42□□□□□ -0.1
F13bQ07968 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
F13bQ07968 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
F13bQ07968 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.42□□□□□ -0.1
F13bQ07968 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
F13bQ07968 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
F13bQ07968 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC14.42□□□□□ -0.1
F13bQ07968 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC14.42□□□□□ -0.1
F13bQ07968 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
F13bQ07968 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
F13bQ07968 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
F13bQ07968 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC14.41□□□□□ -0.1
F13bQ07968 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
F13bQ07968 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
F13bQ07968 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
F13bQ07968 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC14.41□□□□□ -0.1
F13bQ07968 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC14.41□□□□□ -0.1
F13bQ07968 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
F13bQ07968 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
F13bQ07968 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
F13bQ07968 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.41□□□□□ -0.1
F13bQ07968 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
F13bQ07968 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
F13bQ07968 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
F13bQ07968 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
F13bQ07968 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
F13bQ07968 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC14.41□□□□□ -0.1
F13bQ07968 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
F13bQ07968 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
F13bQ07968 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
F13bQ07968 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.7 ms