Protein–RNA interactions for Protein: Q07802

Ebf1, Transcription factor COE1, mousemouse

Predictions only

Length 591 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ebf1Q07802 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ebf1Q07802 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ebf1Q07802 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ebf1Q07802 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ebf1Q07802 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ebf1Q07802 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ebf1Q07802 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ebf1Q07802 Gm43514-201ENSMUST00000198852 424 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Ebf1Q07802 Gm6443-201ENSMUST00000203599 874 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Ebf1Q07802 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ebf1Q07802 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ebf1Q07802 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ebf1Q07802 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ebf1Q07802 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ebf1Q07802 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ebf1Q07802 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ebf1Q07802 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ebf1Q07802 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ebf1Q07802 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Ebf1Q07802 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.3
Ebf1Q07802 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Ebf1Q07802 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Ebf1Q07802 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ebf1Q07802 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ebf1Q07802 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ebf1Q07802 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ebf1Q07802 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ebf1Q07802 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ebf1Q07802 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ebf1Q07802 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ebf1Q07802 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ebf1Q07802 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ebf1Q07802 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ebf1Q07802 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ebf1Q07802 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ebf1Q07802 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ebf1Q07802 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ebf1Q07802 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ebf1Q07802 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ebf1Q07802 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ebf1Q07802 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ebf1Q07802 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ebf1Q07802 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ebf1Q07802 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ebf1Q07802 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ebf1Q07802 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ebf1Q07802 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ebf1Q07802 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ebf1Q07802 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ebf1Q07802 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ebf1Q07802 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ebf1Q07802 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ebf1Q07802 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ebf1Q07802 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ebf1Q07802 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ebf1Q07802 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ebf1Q07802 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ebf1Q07802 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ebf1Q07802 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ebf1Q07802 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ebf1Q07802 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ebf1Q07802 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ebf1Q07802 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ebf1Q07802 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ebf1Q07802 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ebf1Q07802 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ebf1Q07802 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ebf1Q07802 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ebf1Q07802 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ebf1Q07802 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ebf1Q07802 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ebf1Q07802 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ebf1Q07802 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ebf1Q07802 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Ebf1Q07802 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ebf1Q07802 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ebf1Q07802 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ebf1Q07802 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ebf1Q07802 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ebf1Q07802 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ebf1Q07802 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ebf1Q07802 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ebf1Q07802 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ebf1Q07802 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ebf1Q07802 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ebf1Q07802 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ebf1Q07802 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ebf1Q07802 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ebf1Q07802 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Ebf1Q07802 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ebf1Q07802 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ebf1Q07802 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ebf1Q07802 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ebf1Q07802 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ebf1Q07802 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ebf1Q07802 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ebf1Q07802 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ebf1Q07802 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ebf1Q07802 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ebf1Q07802 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.5 ms