Protein–RNA interactions for Protein: Q06831

Sox4, Transcription factor SOX-4, mousemouse

Predictions only

Length 440 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sox4Q06831 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sox4Q06831 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sox4Q06831 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sox4Q06831 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sox4Q06831 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Sox4Q06831 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sox4Q06831 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sox4Q06831 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sox4Q06831 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sox4Q06831 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sox4Q06831 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sox4Q06831 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sox4Q06831 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sox4Q06831 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sox4Q06831 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sox4Q06831 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sox4Q06831 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sox4Q06831 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sox4Q06831 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sox4Q06831 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sox4Q06831 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Sox4Q06831 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sox4Q06831 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sox4Q06831 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sox4Q06831 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sox4Q06831 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Sox4Q06831 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sox4Q06831 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sox4Q06831 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sox4Q06831 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sox4Q06831 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sox4Q06831 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sox4Q06831 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sox4Q06831 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sox4Q06831 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sox4Q06831 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sox4Q06831 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sox4Q06831 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sox4Q06831 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sox4Q06831 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sox4Q06831 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sox4Q06831 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sox4Q06831 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sox4Q06831 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sox4Q06831 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sox4Q06831 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sox4Q06831 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sox4Q06831 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sox4Q06831 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sox4Q06831 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sox4Q06831 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sox4Q06831 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sox4Q06831 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Sox4Q06831 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sox4Q06831 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sox4Q06831 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Sox4Q06831 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sox4Q06831 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sox4Q06831 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Sox4Q06831 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sox4Q06831 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Sox4Q06831 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Sox4Q06831 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sox4Q06831 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sox4Q06831 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sox4Q06831 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sox4Q06831 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sox4Q06831 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sox4Q06831 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sox4Q06831 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sox4Q06831 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sox4Q06831 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sox4Q06831 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sox4Q06831 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sox4Q06831 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sox4Q06831 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sox4Q06831 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sox4Q06831 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sox4Q06831 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sox4Q06831 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Sox4Q06831 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sox4Q06831 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sox4Q06831 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sox4Q06831 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sox4Q06831 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sox4Q06831 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sox4Q06831 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sox4Q06831 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sox4Q06831 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sox4Q06831 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sox4Q06831 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sox4Q06831 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sox4Q06831 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sox4Q06831 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sox4Q06831 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sox4Q06831 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sox4Q06831 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sox4Q06831 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sox4Q06831 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Sox4Q06831 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.1 ms