Protein–RNA interactions for Protein: Q05895

Thbs3, Thrombospondin-3, mousemouse

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Length 956 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Thbs3Q05895 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Thbs3Q05895 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Thbs3Q05895 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Thbs3Q05895 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Thbs3Q05895 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Thbs3Q05895 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Thbs3Q05895 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Thbs3Q05895 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Thbs3Q05895 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Thbs3Q05895 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Thbs3Q05895 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Thbs3Q05895 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Thbs3Q05895 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Thbs3Q05895 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Thbs3Q05895 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Thbs3Q05895 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Thbs3Q05895 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Thbs3Q05895 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Thbs3Q05895 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Thbs3Q05895 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Thbs3Q05895 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Thbs3Q05895 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Thbs3Q05895 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Thbs3Q05895 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Thbs3Q05895 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Thbs3Q05895 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Thbs3Q05895 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Thbs3Q05895 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Thbs3Q05895 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Thbs3Q05895 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Thbs3Q05895 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Thbs3Q05895 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Thbs3Q05895 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Thbs3Q05895 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Thbs3Q05895 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Thbs3Q05895 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Thbs3Q05895 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Thbs3Q05895 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Thbs3Q05895 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Thbs3Q05895 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Thbs3Q05895 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Thbs3Q05895 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Thbs3Q05895 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Thbs3Q05895 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Thbs3Q05895 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Thbs3Q05895 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Thbs3Q05895 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Thbs3Q05895 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Thbs3Q05895 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Thbs3Q05895 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Thbs3Q05895 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Thbs3Q05895 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Thbs3Q05895 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Thbs3Q05895 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Thbs3Q05895 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Thbs3Q05895 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Thbs3Q05895 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Thbs3Q05895 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Thbs3Q05895 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Thbs3Q05895 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Thbs3Q05895 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Thbs3Q05895 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Thbs3Q05895 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Thbs3Q05895 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Thbs3Q05895 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
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Thbs3Q05895 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Thbs3Q05895 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
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Thbs3Q05895 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Thbs3Q05895 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Thbs3Q05895 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Thbs3Q05895 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Thbs3Q05895 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Thbs3Q05895 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Thbs3Q05895 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Thbs3Q05895 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Thbs3Q05895 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Thbs3Q05895 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Thbs3Q05895 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Thbs3Q05895 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Thbs3Q05895 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Thbs3Q05895 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Thbs3Q05895 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Thbs3Q05895 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Thbs3Q05895 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Thbs3Q05895 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Thbs3Q05895 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Thbs3Q05895 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Thbs3Q05895 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Thbs3Q05895 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Thbs3Q05895 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Thbs3Q05895 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Thbs3Q05895 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Thbs3Q05895 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Thbs3Q05895 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Thbs3Q05895 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Thbs3Q05895 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
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