Protein–RNA interactions for Protein: Q04744

Emx2, Homeobox protein EMX2, mousemouse

Predictions only

Length 253 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Emx2Q04744 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Emx2Q04744 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Emx2Q04744 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Emx2Q04744 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Emx2Q04744 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Emx2Q04744 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Emx2Q04744 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Emx2Q04744 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Emx2Q04744 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Emx2Q04744 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Emx2Q04744 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Emx2Q04744 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Emx2Q04744 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Emx2Q04744 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Emx2Q04744 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Emx2Q04744 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Emx2Q04744 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Emx2Q04744 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Emx2Q04744 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Emx2Q04744 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Emx2Q04744 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Emx2Q04744 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Emx2Q04744 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Emx2Q04744 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Emx2Q04744 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Emx2Q04744 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Emx2Q04744 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Emx2Q04744 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Emx2Q04744 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Emx2Q04744 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Emx2Q04744 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Emx2Q04744 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Emx2Q04744 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Emx2Q04744 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Emx2Q04744 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Emx2Q04744 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Emx2Q04744 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Emx2Q04744 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Emx2Q04744 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Emx2Q04744 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Emx2Q04744 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Emx2Q04744 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Emx2Q04744 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Emx2Q04744 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Emx2Q04744 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Emx2Q04744 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Emx2Q04744 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Emx2Q04744 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Emx2Q04744 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Emx2Q04744 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Emx2Q04744 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Emx2Q04744 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Emx2Q04744 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Emx2Q04744 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Emx2Q04744 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Emx2Q04744 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Emx2Q04744 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Emx2Q04744 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Emx2Q04744 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Emx2Q04744 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Emx2Q04744 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Emx2Q04744 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Emx2Q04744 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Emx2Q04744 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Emx2Q04744 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Emx2Q04744 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Emx2Q04744 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Emx2Q04744 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Emx2Q04744 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Emx2Q04744 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Emx2Q04744 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Emx2Q04744 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Emx2Q04744 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Emx2Q04744 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Emx2Q04744 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Emx2Q04744 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Emx2Q04744 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Emx2Q04744 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Emx2Q04744 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Emx2Q04744 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Emx2Q04744 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Emx2Q04744 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Emx2Q04744 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Emx2Q04744 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Emx2Q04744 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Emx2Q04744 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Emx2Q04744 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Emx2Q04744 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Emx2Q04744 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Emx2Q04744 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Emx2Q04744 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Emx2Q04744 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Emx2Q04744 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Emx2Q04744 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Emx2Q04744 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Emx2Q04744 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Emx2Q04744 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Emx2Q04744 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Emx2Q04744 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Emx2Q04744 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.1 ms