Protein–RNA interactions for Protein: Q03517

Scg2, Secretogranin-2, mousemouse

Predictions only

Length 617 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scg2Q03517 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Scg2Q03517 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Scg2Q03517 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Scg2Q03517 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Scg2Q03517 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Scg2Q03517 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Scg2Q03517 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Scg2Q03517 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Scg2Q03517 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Scg2Q03517 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Scg2Q03517 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
Scg2Q03517 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
Scg2Q03517 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Scg2Q03517 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Scg2Q03517 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Scg2Q03517 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Scg2Q03517 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Scg2Q03517 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Scg2Q03517 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Scg2Q03517 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Scg2Q03517 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Scg2Q03517 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Scg2Q03517 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Scg2Q03517 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Scg2Q03517 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Scg2Q03517 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Scg2Q03517 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Scg2Q03517 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Scg2Q03517 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Scg2Q03517 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Scg2Q03517 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Scg2Q03517 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Scg2Q03517 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Scg2Q03517 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Scg2Q03517 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Scg2Q03517 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Scg2Q03517 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Scg2Q03517 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Scg2Q03517 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Scg2Q03517 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Scg2Q03517 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Scg2Q03517 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Scg2Q03517 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Scg2Q03517 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Scg2Q03517 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Scg2Q03517 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Scg2Q03517 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Scg2Q03517 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Scg2Q03517 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Scg2Q03517 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Scg2Q03517 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Scg2Q03517 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Scg2Q03517 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Scg2Q03517 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Scg2Q03517 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Scg2Q03517 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Scg2Q03517 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
Scg2Q03517 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Scg2Q03517 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
Scg2Q03517 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Scg2Q03517 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Scg2Q03517 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
Scg2Q03517 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Scg2Q03517 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Scg2Q03517 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Scg2Q03517 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Scg2Q03517 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Scg2Q03517 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Scg2Q03517 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Scg2Q03517 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Scg2Q03517 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
Scg2Q03517 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Scg2Q03517 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Scg2Q03517 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Scg2Q03517 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
Scg2Q03517 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
Scg2Q03517 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Scg2Q03517 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Scg2Q03517 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Scg2Q03517 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Scg2Q03517 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Scg2Q03517 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Scg2Q03517 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Scg2Q03517 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Scg2Q03517 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Scg2Q03517 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Scg2Q03517 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Scg2Q03517 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Scg2Q03517 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Scg2Q03517 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Scg2Q03517 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Scg2Q03517 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Scg2Q03517 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Scg2Q03517 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Scg2Q03517 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Scg2Q03517 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.66
Scg2Q03517 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Scg2Q03517 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Scg2Q03517 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Scg2Q03517 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.1 ms