Protein–RNA interactions for Protein: Q03402

Crisp3, Cysteine-rich secretory protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 241 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Crisp3Q03402 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Crisp3Q03402 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Crisp3Q03402 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Crisp3Q03402 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Crisp3Q03402 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Crisp3Q03402 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Crisp3Q03402 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Crisp3Q03402 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Crisp3Q03402 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Crisp3Q03402 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Crisp3Q03402 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Crisp3Q03402 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Crisp3Q03402 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Crisp3Q03402 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Crisp3Q03402 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Crisp3Q03402 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Crisp3Q03402 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Crisp3Q03402 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Crisp3Q03402 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Crisp3Q03402 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Crisp3Q03402 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Crisp3Q03402 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Crisp3Q03402 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Crisp3Q03402 Tle1-203ENSMUST00000074216 4369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Crisp3Q03402 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Crisp3Q03402 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Crisp3Q03402 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Crisp3Q03402 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Crisp3Q03402 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Crisp3Q03402 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Crisp3Q03402 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Crisp3Q03402 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC13.58□□□□□ -0.23
Crisp3Q03402 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Crisp3Q03402 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Crisp3Q03402 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Crisp3Q03402 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Crisp3Q03402 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Crisp3Q03402 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Crisp3Q03402 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Crisp3Q03402 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Crisp3Q03402 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Crisp3Q03402 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Crisp3Q03402 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Crisp3Q03402 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Crisp3Q03402 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Crisp3Q03402 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Crisp3Q03402 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Crisp3Q03402 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Crisp3Q03402 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Crisp3Q03402 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Crisp3Q03402 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Crisp3Q03402 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Crisp3Q03402 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Crisp3Q03402 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Crisp3Q03402 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Crisp3Q03402 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Crisp3Q03402 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Crisp3Q03402 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Crisp3Q03402 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Crisp3Q03402 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Crisp3Q03402 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Crisp3Q03402 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Crisp3Q03402 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Crisp3Q03402 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Crisp3Q03402 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Crisp3Q03402 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Crisp3Q03402 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Crisp3Q03402 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Crisp3Q03402 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Crisp3Q03402 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Crisp3Q03402 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Crisp3Q03402 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Crisp3Q03402 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Crisp3Q03402 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Crisp3Q03402 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Crisp3Q03402 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Crisp3Q03402 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Crisp3Q03402 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Crisp3Q03402 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Crisp3Q03402 Slc39a11-201ENSMUST00000042657 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Crisp3Q03402 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Crisp3Q03402 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Crisp3Q03402 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Crisp3Q03402 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Crisp3Q03402 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Crisp3Q03402 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Crisp3Q03402 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Crisp3Q03402 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Crisp3Q03402 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Crisp3Q03402 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Crisp3Q03402 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Crisp3Q03402 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Crisp3Q03402 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Crisp3Q03402 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Crisp3Q03402 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Crisp3Q03402 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Crisp3Q03402 Fam169b-201ENSMUST00000098378 2776 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Crisp3Q03402 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Crisp3Q03402 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Crisp3Q03402 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.1 ms