Protein–RNA interactions for Protein: Q03137

Epha4, Ephrin type-A receptor 4, mousemouse

Predictions only

Length 986 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Epha4Q03137 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Epha4Q03137 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Epha4Q03137 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Epha4Q03137 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Epha4Q03137 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Epha4Q03137 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Epha4Q03137 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Epha4Q03137 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Epha4Q03137 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Epha4Q03137 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Epha4Q03137 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Epha4Q03137 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Epha4Q03137 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Epha4Q03137 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Epha4Q03137 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Epha4Q03137 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Epha4Q03137 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Epha4Q03137 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Epha4Q03137 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Epha4Q03137 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Epha4Q03137 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Epha4Q03137 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Epha4Q03137 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Epha4Q03137 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Epha4Q03137 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Epha4Q03137 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Epha4Q03137 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Epha4Q03137 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Epha4Q03137 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Epha4Q03137 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Epha4Q03137 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Epha4Q03137 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Epha4Q03137 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Epha4Q03137 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Epha4Q03137 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Epha4Q03137 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Epha4Q03137 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Epha4Q03137 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Epha4Q03137 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Epha4Q03137 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Epha4Q03137 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Epha4Q03137 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Epha4Q03137 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Epha4Q03137 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Epha4Q03137 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Epha4Q03137 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Epha4Q03137 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Epha4Q03137 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Epha4Q03137 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Epha4Q03137 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Epha4Q03137 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Epha4Q03137 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Epha4Q03137 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Epha4Q03137 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Epha4Q03137 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Epha4Q03137 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Epha4Q03137 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Epha4Q03137 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Epha4Q03137 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Epha4Q03137 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Epha4Q03137 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Epha4Q03137 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Epha4Q03137 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Epha4Q03137 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Epha4Q03137 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Epha4Q03137 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Epha4Q03137 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Epha4Q03137 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Epha4Q03137 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Epha4Q03137 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Epha4Q03137 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Epha4Q03137 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Epha4Q03137 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Epha4Q03137 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Epha4Q03137 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Epha4Q03137 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Epha4Q03137 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Epha4Q03137 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Epha4Q03137 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Epha4Q03137 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Epha4Q03137 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Epha4Q03137 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Epha4Q03137 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Epha4Q03137 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Epha4Q03137 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Epha4Q03137 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Epha4Q03137 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Epha4Q03137 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Epha4Q03137 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Epha4Q03137 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Epha4Q03137 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Epha4Q03137 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Epha4Q03137 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Epha4Q03137 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Epha4Q03137 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Epha4Q03137 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Epha4Q03137 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Epha4Q03137 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Epha4Q03137 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Epha4Q03137 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.6 ms