Protein–RNA interactions for Protein: Q02789

Cacna1s, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit alpha-1S, mousemouse

Predictions only

Length 1,880 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cacna1sQ02789 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Cacna1sQ02789 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Cacna1sQ02789 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Cacna1sQ02789 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Cacna1sQ02789 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Cacna1sQ02789 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Cacna1sQ02789 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Cacna1sQ02789 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
Cacna1sQ02789 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Cacna1sQ02789 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Cacna1sQ02789 P2rx6-203ENSMUST00000171002 1353 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Cacna1sQ02789 Hbb-bh0-201ENSMUST00000124800 129 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
Cacna1sQ02789 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Cacna1sQ02789 Dhrs7c-205ENSMUST00000168612 1108 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Cacna1sQ02789 Rgs10-201ENSMUST00000033133 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Cacna1sQ02789 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Cacna1sQ02789 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
Cacna1sQ02789 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Cacna1sQ02789 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Cacna1sQ02789 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Cacna1sQ02789 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Cacna1sQ02789 Gm2109-201ENSMUST00000189326 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Cacna1sQ02789 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Cacna1sQ02789 Gm20661-203ENSMUST00000177368 900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Cacna1sQ02789 Gm27494-201ENSMUST00000184735 189 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
Cacna1sQ02789 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
Cacna1sQ02789 Gm43438-201ENSMUST00000198133 379 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
Cacna1sQ02789 Ftl1-ps1-202ENSMUST00000222435 938 ntAPPRIS P1 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Cacna1sQ02789 Lce1b-201ENSMUST00000029531 647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Cacna1sQ02789 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Cacna1sQ02789 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
Cacna1sQ02789 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
Cacna1sQ02789 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Cacna1sQ02789 Adprhl1-201ENSMUST00000033825 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Cacna1sQ02789 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Cacna1sQ02789 Gm5312-201ENSMUST00000203728 547 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
Cacna1sQ02789 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Cacna1sQ02789 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Cacna1sQ02789 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Cacna1sQ02789 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Cacna1sQ02789 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Cacna1sQ02789 Cep250-203ENSMUST00000109618 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Cacna1sQ02789 Pcp2-203ENSMUST00000133459 470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Cacna1sQ02789 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Cacna1sQ02789 Gm26854-201ENSMUST00000180418 705 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Cacna1sQ02789 Pcp2-201ENSMUST00000004749 495 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Cacna1sQ02789 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Cacna1sQ02789 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Cacna1sQ02789 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Cacna1sQ02789 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Cacna1sQ02789 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Cacna1sQ02789 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Cacna1sQ02789 Ube2v2-202ENSMUST00000115776 1236 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Cacna1sQ02789 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Cacna1sQ02789 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
Cacna1sQ02789 6030443J06Rik-204ENSMUST00000195898 786 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Cacna1sQ02789 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Cacna1sQ02789 Cplx3-202ENSMUST00000215487 594 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Cacna1sQ02789 Nxnl2-201ENSMUST00000021828 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Cacna1sQ02789 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Cacna1sQ02789 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
Cacna1sQ02789 Iqcj-201ENSMUST00000063263 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Cacna1sQ02789 Pycrl-201ENSMUST00000053918 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Cacna1sQ02789 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Cacna1sQ02789 Arhgap27os1-201ENSMUST00000130556 923 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Cacna1sQ02789 AA543401-201ENSMUST00000164248 1269 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
Cacna1sQ02789 Esd-207ENSMUST00000176957 1117 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Cacna1sQ02789 Gm27300-201ENSMUST00000184085 97 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
Cacna1sQ02789 Gm27335-201ENSMUST00000184758 97 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
Cacna1sQ02789 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Cacna1sQ02789 Chchd10-201ENSMUST00000058906 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Cacna1sQ02789 Lypd1-201ENSMUST00000027582 1447 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Cacna1sQ02789 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Cacna1sQ02789 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Cacna1sQ02789 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Cacna1sQ02789 Gm13597-201ENSMUST00000121239 375 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
Cacna1sQ02789 Xrcc2-204ENSMUST00000134972 464 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Cacna1sQ02789 Bcl2l2-204ENSMUST00000172844 498 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Cacna1sQ02789 Gm45091-201ENSMUST00000205799 504 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Cacna1sQ02789 Gm34397-203ENSMUST00000214991 630 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Cacna1sQ02789 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
Cacna1sQ02789 Krtap19-4-201ENSMUST00000051103 304 ntAPPRIS P1 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Cacna1sQ02789 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Cacna1sQ02789 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Cacna1sQ02789 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Cacna1sQ02789 Rapgef6-205ENSMUST00000108895 1829 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Cacna1sQ02789 Tnnc2-201ENSMUST00000103095 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Cacna1sQ02789 Slc7a10-203ENSMUST00000135452 629 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Cacna1sQ02789 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Cacna1sQ02789 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Cacna1sQ02789 Sfxn5-203ENSMUST00000113787 638 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Cacna1sQ02789 Zdhhc23-202ENSMUST00000165648 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Cacna1sQ02789 Gm20680-201ENSMUST00000176881 789 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Cacna1sQ02789 AC159295.1-201ENSMUST00000225326 940 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
Cacna1sQ02789 Emg1-201ENSMUST00000004379 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Cacna1sQ02789 Celf5-203ENSMUST00000120508 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Cacna1sQ02789 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Cacna1sQ02789 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Cacna1sQ02789 Gm45799-202ENSMUST00000106786 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Cacna1sQ02789 Zfp511-201ENSMUST00000168194 1076 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.9 ms