Protein–RNA interactions for Protein: Q02780

Nfia, Nuclear factor 1 A-type, mousemouse

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Length 532 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NfiaQ02780 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
NfiaQ02780 1600014C10Rik-209ENSMUST00000179992 568 ntTSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
NfiaQ02780 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
NfiaQ02780 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
NfiaQ02780 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
NfiaQ02780 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
NfiaQ02780 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
NfiaQ02780 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
NfiaQ02780 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
NfiaQ02780 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
NfiaQ02780 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
NfiaQ02780 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
NfiaQ02780 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
NfiaQ02780 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
NfiaQ02780 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
NfiaQ02780 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
NfiaQ02780 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
NfiaQ02780 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
NfiaQ02780 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
NfiaQ02780 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
NfiaQ02780 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
NfiaQ02780 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
NfiaQ02780 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
NfiaQ02780 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
NfiaQ02780 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
NfiaQ02780 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
NfiaQ02780 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
NfiaQ02780 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
NfiaQ02780 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
NfiaQ02780 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
NfiaQ02780 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
NfiaQ02780 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
NfiaQ02780 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
NfiaQ02780 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
NfiaQ02780 Gm21586-201ENSMUST00000107988 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
NfiaQ02780 Gm21953-201ENSMUST00000108002 264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
NfiaQ02780 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
NfiaQ02780 Gm11906-201ENSMUST00000124792 680 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
NfiaQ02780 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
NfiaQ02780 Gm20878-208ENSMUST00000181518 264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
NfiaQ02780 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
NfiaQ02780 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC18.61■□□□□ 0.57
NfiaQ02780 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
NfiaQ02780 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
NfiaQ02780 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
NfiaQ02780 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
NfiaQ02780 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
NfiaQ02780 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
NfiaQ02780 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
NfiaQ02780 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
NfiaQ02780 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
NfiaQ02780 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
NfiaQ02780 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
NfiaQ02780 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
NfiaQ02780 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
NfiaQ02780 Gm44357-201ENSMUST00000195897 142 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
NfiaQ02780 Gm19658-201ENSMUST00000196231 138 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
NfiaQ02780 Gm44367-201ENSMUST00000196836 138 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
NfiaQ02780 Gm44350-201ENSMUST00000197197 138 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
NfiaQ02780 Gm44390-201ENSMUST00000197533 144 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
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NfiaQ02780 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
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NfiaQ02780 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
NfiaQ02780 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
NfiaQ02780 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
NfiaQ02780 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
NfiaQ02780 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
NfiaQ02780 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
NfiaQ02780 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
NfiaQ02780 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
NfiaQ02780 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
NfiaQ02780 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
NfiaQ02780 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
NfiaQ02780 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
NfiaQ02780 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
NfiaQ02780 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
NfiaQ02780 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
NfiaQ02780 Rps27l-203ENSMUST00000127896 575 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
NfiaQ02780 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
NfiaQ02780 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
NfiaQ02780 Cox6c-205ENSMUST00000156915 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
NfiaQ02780 AC132104.2-201ENSMUST00000215011 266 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
NfiaQ02780 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
NfiaQ02780 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
NfiaQ02780 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
NfiaQ02780 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
NfiaQ02780 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
NfiaQ02780 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
NfiaQ02780 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
NfiaQ02780 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
NfiaQ02780 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
NfiaQ02780 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
NfiaQ02780 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
NfiaQ02780 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.9 ms