Protein–RNA interactions for Protein: Q02739

Gjb5, Gap junction beta-5 protein, mousemouse

Predictions only

Length 271 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gjb5Q02739 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Gjb5Q02739 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Gjb5Q02739 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Gjb5Q02739 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Gjb5Q02739 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Gjb5Q02739 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Gjb5Q02739 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Gjb5Q02739 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Gjb5Q02739 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Gjb5Q02739 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Gjb5Q02739 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Gjb5Q02739 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Gjb5Q02739 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Gjb5Q02739 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Gjb5Q02739 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Gjb5Q02739 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Gjb5Q02739 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Gjb5Q02739 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Gjb5Q02739 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Gjb5Q02739 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Gjb5Q02739 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Gjb5Q02739 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Gjb5Q02739 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Gjb5Q02739 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Gjb5Q02739 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Gjb5Q02739 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Gjb5Q02739 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Gjb5Q02739 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Gjb5Q02739 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Gjb5Q02739 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Gjb5Q02739 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Gjb5Q02739 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Gjb5Q02739 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Gjb5Q02739 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Gjb5Q02739 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Gjb5Q02739 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Gjb5Q02739 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Gjb5Q02739 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Gjb5Q02739 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Gjb5Q02739 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Gjb5Q02739 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Gjb5Q02739 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Gjb5Q02739 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Gjb5Q02739 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Gjb5Q02739 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Gjb5Q02739 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Gjb5Q02739 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Gjb5Q02739 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Gjb5Q02739 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Gjb5Q02739 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Gjb5Q02739 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Gjb5Q02739 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Gjb5Q02739 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Gjb5Q02739 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Gjb5Q02739 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Gjb5Q02739 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Gjb5Q02739 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Gjb5Q02739 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Gjb5Q02739 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Gjb5Q02739 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Gjb5Q02739 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Gjb5Q02739 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Gjb5Q02739 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Gjb5Q02739 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Gjb5Q02739 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Gjb5Q02739 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Gjb5Q02739 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Gjb5Q02739 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Gjb5Q02739 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Gjb5Q02739 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Gjb5Q02739 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Gjb5Q02739 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Gjb5Q02739 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Gjb5Q02739 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Gjb5Q02739 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Gjb5Q02739 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Gjb5Q02739 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Gjb5Q02739 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Gjb5Q02739 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Gjb5Q02739 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Gjb5Q02739 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Gjb5Q02739 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Gjb5Q02739 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Gjb5Q02739 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Gjb5Q02739 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Gjb5Q02739 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Gjb5Q02739 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Gjb5Q02739 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Gjb5Q02739 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Gjb5Q02739 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Gjb5Q02739 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Gjb5Q02739 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Gjb5Q02739 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Gjb5Q02739 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Gjb5Q02739 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gjb5Q02739 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gjb5Q02739 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gjb5Q02739 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gjb5Q02739 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gjb5Q02739 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.8 ms