Protein–RNA interactions for Protein: Q02591

Gsc, Homeobox protein goosecoid, mousemouse

Predictions only

Length 256 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GscQ02591 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
GscQ02591 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
GscQ02591 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
GscQ02591 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
GscQ02591 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
GscQ02591 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
GscQ02591 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
GscQ02591 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
GscQ02591 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
GscQ02591 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
GscQ02591 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
GscQ02591 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
GscQ02591 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
GscQ02591 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
GscQ02591 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
GscQ02591 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
GscQ02591 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
GscQ02591 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
GscQ02591 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
GscQ02591 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
GscQ02591 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
GscQ02591 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
GscQ02591 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
GscQ02591 Amz2-202ENSMUST00000092500 2816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
GscQ02591 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
GscQ02591 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
GscQ02591 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
GscQ02591 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
GscQ02591 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
GscQ02591 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
GscQ02591 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
GscQ02591 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
GscQ02591 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
GscQ02591 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
GscQ02591 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
GscQ02591 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
GscQ02591 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
GscQ02591 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
GscQ02591 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
GscQ02591 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
GscQ02591 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
GscQ02591 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
GscQ02591 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
GscQ02591 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
GscQ02591 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
GscQ02591 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
GscQ02591 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
GscQ02591 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.44
GscQ02591 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
GscQ02591 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
GscQ02591 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
GscQ02591 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
GscQ02591 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
GscQ02591 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
GscQ02591 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
GscQ02591 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
GscQ02591 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
GscQ02591 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
GscQ02591 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
GscQ02591 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
GscQ02591 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
GscQ02591 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
GscQ02591 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
GscQ02591 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
GscQ02591 Sgk1-202ENSMUST00000092673 2576 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
GscQ02591 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
GscQ02591 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
GscQ02591 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
GscQ02591 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
GscQ02591 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
GscQ02591 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
GscQ02591 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
GscQ02591 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
GscQ02591 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
GscQ02591 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
GscQ02591 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
GscQ02591 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
GscQ02591 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
GscQ02591 4933435F18Rik-202ENSMUST00000154878 2174 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
GscQ02591 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
GscQ02591 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
GscQ02591 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
GscQ02591 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
GscQ02591 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
GscQ02591 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
GscQ02591 Rnd1-201ENSMUST00000003451 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
GscQ02591 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
GscQ02591 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
GscQ02591 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
GscQ02591 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
GscQ02591 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
GscQ02591 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
GscQ02591 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
GscQ02591 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
GscQ02591 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
GscQ02591 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
GscQ02591 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
GscQ02591 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
GscQ02591 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
GscQ02591 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.5 ms