Protein–RNA interactions for Protein: Q02576

Nhlh1, Helix-loop-helix protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 133 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nhlh1Q02576 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Nhlh1Q02576 Meig1-204ENSMUST00000115083 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Nhlh1Q02576 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Nhlh1Q02576 Cox7a2l-201ENSMUST00000025095 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Nhlh1Q02576 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Nhlh1Q02576 Eif5-201ENSMUST00000050993 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Nhlh1Q02576 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Nhlh1Q02576 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Nhlh1Q02576 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Nhlh1Q02576 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Nhlh1Q02576 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Nhlh1Q02576 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Nhlh1Q02576 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Nhlh1Q02576 Ltc4s-202ENSMUST00000102772 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Nhlh1Q02576 Dio1-202ENSMUST00000106748 396 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Nhlh1Q02576 Hagh-202ENSMUST00000118788 1191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Nhlh1Q02576 Rpl36-ps8-201ENSMUST00000121187 315 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Nhlh1Q02576 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Nhlh1Q02576 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Nhlh1Q02576 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Nhlh1Q02576 AA465934-202ENSMUST00000176545 356 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Nhlh1Q02576 Gm37171-201ENSMUST00000192636 1185 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Nhlh1Q02576 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Nhlh1Q02576 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Nhlh1Q02576 Gm8396-201ENSMUST00000057361 823 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Nhlh1Q02576 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Nhlh1Q02576 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Nhlh1Q02576 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Nhlh1Q02576 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Nhlh1Q02576 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Nhlh1Q02576 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Nhlh1Q02576 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Nhlh1Q02576 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Nhlh1Q02576 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Nhlh1Q02576 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Nhlh1Q02576 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Nhlh1Q02576 Asphd1-202ENSMUST00000106339 518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Nhlh1Q02576 Prmt7-203ENSMUST00000109297 1094 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Nhlh1Q02576 Siva1-202ENSMUST00000109755 333 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Nhlh1Q02576 Hbb-bh0-201ENSMUST00000124800 129 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Nhlh1Q02576 Gm45091-201ENSMUST00000205799 504 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Nhlh1Q02576 Gm34397-203ENSMUST00000214991 630 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Nhlh1Q02576 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Nhlh1Q02576 Lce1b-201ENSMUST00000029531 647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Nhlh1Q02576 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Nhlh1Q02576 Olfr1410-201ENSMUST00000079790 969 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Nhlh1Q02576 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Nhlh1Q02576 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Nhlh1Q02576 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Nhlh1Q02576 Mef2b-205ENSMUST00000163756 1337 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Nhlh1Q02576 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Nhlh1Q02576 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Nhlh1Q02576 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Nhlh1Q02576 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Nhlh1Q02576 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Nhlh1Q02576 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Nhlh1Q02576 1700003M07Rik-202ENSMUST00000147634 564 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Nhlh1Q02576 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Nhlh1Q02576 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Nhlh1Q02576 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Nhlh1Q02576 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Nhlh1Q02576 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Nhlh1Q02576 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Nhlh1Q02576 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Nhlh1Q02576 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Nhlh1Q02576 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Nhlh1Q02576 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Nhlh1Q02576 Pcp2-204ENSMUST00000136105 504 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Nhlh1Q02576 Gm15598-201ENSMUST00000156965 763 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Nhlh1Q02576 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Nhlh1Q02576 Smdt1-201ENSMUST00000023086 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Nhlh1Q02576 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Nhlh1Q02576 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Nhlh1Q02576 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Nhlh1Q02576 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Nhlh1Q02576 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Nhlh1Q02576 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Nhlh1Q02576 Celf5-203ENSMUST00000120508 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Nhlh1Q02576 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Nhlh1Q02576 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Nhlh1Q02576 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Nhlh1Q02576 Ing4-201ENSMUST00000032480 1629 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Nhlh1Q02576 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Nhlh1Q02576 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Nhlh1Q02576 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Nhlh1Q02576 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Nhlh1Q02576 Cpt2-203ENSMUST00000106720 1015 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Nhlh1Q02576 Acyp1-203ENSMUST00000117138 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Nhlh1Q02576 Ntpcr-205ENSMUST00000143504 520 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Nhlh1Q02576 AA543401-201ENSMUST00000164248 1269 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Nhlh1Q02576 Gm26854-201ENSMUST00000180418 705 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Nhlh1Q02576 Arf5-201ENSMUST00000020717 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Nhlh1Q02576 Gm7229-201ENSMUST00000214719 1007 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Nhlh1Q02576 2010107E04Rik-203ENSMUST00000222874 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Nhlh1Q02576 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Nhlh1Q02576 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Nhlh1Q02576 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Nhlh1Q02576 Fam103a1-202ENSMUST00000118190 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Nhlh1Q02576 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Nhlh1Q02576 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27 ms