Protein–RNA interactions for Protein: Q02525

Zfp39, Zinc finger protein 39, mousemouse

Predictions only

Length 718 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zfp39Q02525 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Zfp39Q02525 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Zfp39Q02525 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Zfp39Q02525 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Zfp39Q02525 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Zfp39Q02525 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Zfp39Q02525 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Zfp39Q02525 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Zfp39Q02525 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Zfp39Q02525 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Zfp39Q02525 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Zfp39Q02525 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Zfp39Q02525 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Zfp39Q02525 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Zfp39Q02525 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Zfp39Q02525 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Zfp39Q02525 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Zfp39Q02525 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Zfp39Q02525 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Zfp39Q02525 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Zfp39Q02525 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Zfp39Q02525 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Zfp39Q02525 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Zfp39Q02525 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Zfp39Q02525 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Zfp39Q02525 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Zfp39Q02525 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Zfp39Q02525 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Zfp39Q02525 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Zfp39Q02525 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Zfp39Q02525 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Zfp39Q02525 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Zfp39Q02525 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Zfp39Q02525 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Zfp39Q02525 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Zfp39Q02525 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Zfp39Q02525 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Zfp39Q02525 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Zfp39Q02525 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Zfp39Q02525 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Zfp39Q02525 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Zfp39Q02525 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Zfp39Q02525 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Zfp39Q02525 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Zfp39Q02525 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Zfp39Q02525 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Zfp39Q02525 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Zfp39Q02525 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Zfp39Q02525 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Zfp39Q02525 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Zfp39Q02525 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Zfp39Q02525 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Zfp39Q02525 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Zfp39Q02525 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Zfp39Q02525 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Zfp39Q02525 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Zfp39Q02525 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Zfp39Q02525 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Zfp39Q02525 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Zfp39Q02525 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Zfp39Q02525 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Zfp39Q02525 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Zfp39Q02525 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Zfp39Q02525 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Zfp39Q02525 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Zfp39Q02525 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Zfp39Q02525 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Zfp39Q02525 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Zfp39Q02525 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Zfp39Q02525 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Zfp39Q02525 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Zfp39Q02525 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Zfp39Q02525 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Zfp39Q02525 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Zfp39Q02525 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Zfp39Q02525 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Zfp39Q02525 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Zfp39Q02525 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Zfp39Q02525 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Zfp39Q02525 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Zfp39Q02525 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Zfp39Q02525 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Zfp39Q02525 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Zfp39Q02525 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Zfp39Q02525 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Zfp39Q02525 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Zfp39Q02525 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Zfp39Q02525 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Zfp39Q02525 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Zfp39Q02525 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Zfp39Q02525 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Zfp39Q02525 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Zfp39Q02525 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Zfp39Q02525 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Zfp39Q02525 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Zfp39Q02525 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Zfp39Q02525 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Zfp39Q02525 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Zfp39Q02525 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Zfp39Q02525 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.5 ms